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2017-烟台-生物信息学数据分析(Python语言应用专题实操班)

会议名称:  2017-烟台-生物信息学数据分析(Python语言应用专题实操班)
会议类型:  培训班
会议时间:  2017-08-18-2017-08-22
会议地点:  山东烟台
会议详情:  

各有关单位:  
生物信息实验中的海量离散数据蕴含着各种显著或潜在的规律和特征,这些规律或特征通常被淹没在随机信号和实验误差之中。将数据变为直观的图表,不仅可以形象化的展现数据中的这些规律,还能表现出数据之间存在着各种直接或间接的联系由于Python语言的简洁、易读以及可扩展性,在国内外用Python做科学计算的研究机构日益增多,在生物信息学和医学领域已经有大量程序软件全部或部分使用Python来设计。Python的使用率呈线性增长,已经成为最受欢迎的程序设计语言之一。  
  
本次培训班课程大纲:  
  
第一天  
Linux 和 Windows 下 Python 语言编写和运行方式  
Python 的安装  
Python 的运行  
IPython notebook 的使用  
   
Python 基本语法和数据结构  
(基于提供的 IPython notebook 同步操作、调试)  
层级缩进  
数值的操作  
字符串的操作  
列表操作  
元组操作  
Range 使用  
字典操作  
   
Python 输入和输出  
屏幕输入和输出  
文件输入和输出  
   
   
Python 实战练习  
读写 FASTA 文件  
读写 FASTQ 文件  
FASTA 序列格式转换  
FASTA 序列排序  
   
   
   
   
第二天  
回顾第一天的知识  
1.提问考核昨天讲过的内容  
   
   
Python 实战练习  
FASTQ 序列提取  
筛选差异基因矩阵  
转换矩阵格式  
简化的序列比对程序  
   
Python 正则表达式  
正则表达式讲解  
re 模块学习  
字符串匹配实战  
   
   
   
第三天  
   
Python 模块和函数操作  
理解 Python 的模块和函数  
Python 模块安装  
函数写作讲解  
   
Python 函数实战练习  
1.第一二天的练习用函数重写,同类功能模块化  
   
Python 命令行参数处理  
理解命令行参数  
Python 命令行参数的处理  
   
   
第四天  
   
 Python 命令行参数实战练习  
1.整合命令行参数处理到第三天的程序,使得程序可以处理同类问题  
1.Python 矩阵处理模块 Pandas 和画图(Python 像 R 一样处理矩阵和画图)  
   
Pandas 库介绍  
矩阵的合并、提取  
矩阵统计分析  
科学绘图 (直方图、箱线图、饼图、密度图、热图)

联系人:  冯老师
电话:  3227283712@qq.com
Email:  13717604109
官方网址:  http://www.int-yt.com/