大多数治病微生物感染都会引发细胞死亡。在部分病例中细菌本身可以直接诱导细胞凋亡，而这个过程的对感染本身产生怎样的影响还不清楚。Grassme等人提出了有力的数据证明在细菌感染时某些宿主细胞的应激性死亡对于宿主的生存来说是必须的。一种导致易感人群出现肺炎和脓毒症的肺炎球菌（Pseudomonas aeruginosa）可以诱导肺表皮细胞广泛性凋亡。这种特定的细胞死亡对于感染了这种Pseudomonas aeruginosa的小鼠的生存至关重要，并且凋亡的产生依赖于细胞死亡受体Fas（CD95）和其配体之间的相互作用。