传统的维吾尔医药在祖国传统医学宝库中占有很大的比重，目前已收入国家级药典的药品就有202种，其中药材115种，成方制剂87种。它和中医、藏医等民族医药学相比，有着其独特的治病理念。维吾尔医药学主要是由气质学说、体液学说、器官学说组成。它认为，人体的病灶主要是由气质失调，异常黑胆质所致，要治病，首先要清除病体内的异常黑胆质。
　　
　　传统而独特的治病理念和世代相传的组药秘方，加上和田民族医院科学的研究和开发，近10年来，他们已研制出复方麝香口服液、香妃强心剂、依木萨克片及治疗白癜风、糖尿病等世界疑难病的13个剂型、147个民族医药品种。其中，依木萨克片和香妃强心剂1997年打入美国、日本、新加坡市场，日本和美国的许多药商多次来和田民族医院，要求买断依木萨克片的专利。
　　
　　据不完全统计，近几年到和田民族医院求医问药的人数逐年增加。今年1至10月，就医人数就达到6．2万人次，收到国内外病人的感谢信百余封、牌匾10余个。其中广东、云南、四川、甘肃等地的病人就占到五六百人，美国、日本、新加坡及哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦等国家的病人占到二三百人。这些病人绝大多数是来求治白癜风和糖尿病的。和田民族医院的阿米娜院长介绍说，目前，他们开发研制出的治疗白癜风的内服、外服药的有效率已达到40％。今年夏天，一位北京的病人专程来到和田民族医院，感谢他们治好了他几十年的白癜风，并希望他们能加快推广的步伐，为更多的病人解除痛苦。
　　
　　新疆医科大学药学院高晓黎博士介绍说，在新疆，不仅和田地区维吾尔医药研究发展较快，乌鲁木齐的维吾尔医药研究所、民族医院、吐鲁番民族医院都在积极努力开发研究，其中许多中成药和中草药成为当地宝贵的资源。近年来，新疆维吾尔医药研究所以及新疆医科大学药学院的研究人员们一直致力于研究多种维吾尔药材，其成果也颇为丰硕。