科学家们呼吁自由地获取基因组数据

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今年六月克林顿总统宣布Crag Venter(左)和Francis Collins(右)共同的基因组计划研究成果。

美国一家基因公司的领导,达成了一项让他自己开发自己的研究成果而不公享这一成果的交易,因而已经激怒了来自公众人类基因组计划的科学家们。

塞莱拉公司的总裁Craig Venter在今年六月同意与公共领域的基因组计划共同公布人类基因组草图。

Venter博士现在计划在Science杂志上发表其工作成果。其他的基因研究者认为这实际上相当于为塞莱拉公司免费做广告,而且开了可能阻碍基因组研究的在研究数据获得方面的先例。

批评者指责了该杂志迎合了Venter博士的野心,赋予了其商业工作以学术价值,而后者恰恰是任何科学家想获得诺贝尔奖所必需的。某些人已经指出塞莱拉公司捐款给Science杂志。

作为抗议,包括Sanger中心和欧洲生物信息学研究所(EBI)的英国科学家在内的,公众领域的基因组研究联盟,将在Science的竞争对手,英国的Nature杂志上发表他们的研究成果。两篇论文都将在明年二月发表。

在两份杂志之中任意一份上发表论文的科学家,通常都必须将有关实验的详细信息递交三个国际数据库中的任何一个,从而可以让独立的研究者验证他们的结果,并且使用他们的发现用来支持自己的研究。然而塞莱拉公司这次和Science达成了协议,将由该公司自己的网站保存全部的数据。

研究者只可以免费获得有限的信息,而商业使用者必须支付费用,任何人要想获得超过一段数据,就必须在之前签署一份详细的法律条约。

EBI基因组项目的领导人Ewan Birney说,这份协议将损害自由获取基础研究信息的原则,该原则在正常情况下是巩固科学出版过程的基础。他说:“这项协议推翻了该领域数据公开的所有过程。”

“如果我们不能获得所有数据,而只能获得小部分数据,那么我们就只能进行单独基因的研究,而不能进行全基因组研究。”

Birney博士已经和美国Howard Hughes医学研究所的Sean Eddy教授共同撰写了一封公开信,呼吁研究者们抗议Science主编Donald Kennedy的行为。

剑桥大学的生物学教授Michael Ashburner说,这一出版条款危害了基因组研究的将来。

Ashburner教授说,他和Birney博士并不反对自己支付研究费用的塞莱拉公司设定自己的数据获得条款和销售自己的数据的原则。但是这家公司不应该寻求在学术出版物上发表论文,除非它同意公开所有的数据。

——摘译自12月19日

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