生物通编译：微阵列技术给基因表达研究带来了革新。现在科学家们证实这一途径可以被用来检测DNA蛋白质相互作用的特异性，从而了解基因调控过程。

传统的研究方法进行这类实验工作量很大，而且只能得到是或不是的结果，而不能揭示结合强度上的变化。而研究者知道后者对于控制体内基因的表达是至关重要的。

但是在一篇将于明天出版的Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS)发表的文章中，来自哈佛医学院的研究者证实他们可以使用微阵列在几天的时间里完成以往一年时间内进行的DNA蛋白结合实验。而且他们从实验中获得的数据是定量的，可以提供细胞中的相对结合亲和能力。

锌指蛋白代表了人类基因组中最大的蛋白家族中的一个。这些蛋白中的每一个都有三个“锌指”以一种序列特异的形式，结合到DNA上的九个碱基序列上（每个“锌指”结合三个碱基）。当一个特定的蛋白质结合到DNA上，就能激活一个临近基因的转录。

哈佛大学遗传学教授George Church说，由于基因组中98%的序列是非蛋白编码区，因此需要通过大规模的方法来寻找可能的结合位点。他和他的同事们检测了750多个DNA-蛋白质相互作用，从微阵列上的探针DNA序列到蛋白的锌指序列都各不相同。

Church告诉BioMedNet News记者说：“我们已经从研究界看到了显著的反应。”他继续说：“我对大家的关注程度感到吃惊，因为这篇文章还没有出来。我们也没有在许多会议上讨论过。在很大程度上，这很象过时的生物化学，但是现在的规模大。”

尽管他们是从相对较确定的锌指家族开始进行的研究，他希望这一方法可以被广泛地应用于许多不同的蛋白文库和核酸文库中。

约翰霍普金斯大学医学院的药学和分子科学系系主任Philip Cole说：“对于这种方法的成功，我并没有感到吃惊。这是在微阵列技术中合理的发展，而且是一个有用的方向。”

但是他指出锌指只结合双链DNA，而到目前为止的芯片实验通常使用的是单链杂交技术。这一点与科学家们正在该系统中使用蛋白质的事实之间，他认为这是一个明显的成功，因为后者比操作核酸要难得多。

Church认为这个技术将提供获得基因表达系统信息的一个非常需要的方法。很有前途的系统生物学领域需要很多基因表达系统的研究。Church说：“该技术将是获得系统生物学信息的一条途径。”（版权所有 转载请注明）

——摘译自6月12日（heartlake）