检测人体外源DNA的新技术

【字体: 时间:2002年01月16日 来源:

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    [生物通讯]研究人员早就怀疑一些类型的癌症和自体免疫疾病可能是由于细菌或病毒的遗传物质溜进我们人体的DNA而引起的,但要跟踪这些入侵DNA是一项艰巨的任务。一项公布于《自然遗传学》网站上的新遗传学技术,可能会帮助研究人员查出这些潜藏在病人基因内的“内奸”。

    子宫癌的研究为传染性疾病能够导致癌症这一观点提供了最好的证据。人体乳头瘤病毒(human papillomavirus ,HPV)能够引起生殖器疣,在90%以上的子宫癌肿瘤中都有出现。哈佛大学波士顿医学院的病理学家Matthew Meyerson和他的同事利用子宫癌作为检测实例来检测病人体内的外源基因。

    将收集自人体子宫癌细胞的7073个活化基因序列组成的计算机文库与人类基因组计划测序完毕的基因组J数据库以及其它人类和小鼠序列数据库做了比较,所有这些基因都假定来自健康个体。文库中有22个基因与数据库中的序列不符。研究人员排除了其中的20个基因,剩下的最后两个基因序列是来自HPV-18病毒的无效环状DNA。HPV-18是早先查明的与子宫癌有关联的感染原。

    斯坦福大学的微生物学家David Relman认为这个方法很有前途。但他警告说;“当你偶然碰到1个转录不符合著名的HPV和子宫癌实例时,挑战就来了。”他怀疑我们的DNA也许已积累了相当一部分无害的微生物小DNA片段,因而要从这些杂乱的“无害合居者”背景中发现病原体的踪迹是一项艰巨的任务。

生物通摘译自SCIENCE NOW,中版权所有,转载请注明

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