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超越基因组时代:破译面包酵母蛋白组
【字体: 大 中 小 】 时间:2002年03月18日 来源:
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[生物通讯]耶鲁大学与Invitrogen公司的研究人员合作完成了迄今最大规模的一次真核细胞蛋白质定位分析。在发表在3月15日期的《基因与发育》(Genes & Development)杂志上,Michael Snyder博士和他的同事报道他们识别了面包酵母Saccharomyces cerevisiae的蛋白组。
尽管S. cerevisiae 的基因组测序工作1996年就完成了,但仍然需要识别6000多个酵母基因编码的超过2000种蛋白产物的功能。
Snyder 博士和他的同事在后基因组时代浪潮中先行一步:大规模了分析面包酵母基因组编码的蛋白--即蛋白组。尽管基因组序列提供了大量的遗传信息,但提供的有关蛋白产物的动力学特性如何驱动细胞生理过程的信息,却很有限。
所有的蛋白(除去一些线粒体和叶绿体蛋白)都是在细胞质的核糖体中合成的,但根据蛋白各自的功能,它们被运往特定的活动场所。由于亚细胞位置是蛋白功能有效的指示器,因而Snyder博士和他的同事设计了一种高通量的方法来标记个体蛋白,显现生活细胞内蛋白质的运动。
Snyder博士和他的同事成功确定了超过2700种酵母蛋白的亚细胞位置。将包括计算机统计法则在内的多种方法组合起来使用,研究人员能够预测酵母所有6100种蛋白的细胞位置。通过这项研究,Snyder博士和他的同事查清了将近一半早先未识别出的酵母蛋白的潜在功能。
这项研究标志着面包酵母蛋白组学的一个重大进展,但这对于潜藏巨大宝藏的后基因组时代而言只是冰山一角。
生物通摘译自BIO.COM