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曙光服务器圆满完成水稻基因测序工程
【字体: 大 中 小 】 时间:2002年04月12日 来源:
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近日,世界权威学术期刊美国《科学》杂志以封面文章形式和显著篇幅,登出中国科学家绘出水稻基因组工作框架图的历史性论文。在我国科学家率先完成水稻基因组“工作框架图”和数据库的过程中,是我国性能最高的超级服务器曙光3000担负了关键的基因组测序和组装分析工作并圆满完成任务。据了解,中国完成水稻基因框架图字只花费了1亿多元人民币,而同类项目在国外需投入1亿美元。正是基于国产高端服务器的强力支持,使本次基因测序成本降低到中国“人类基因组计划”的三分之一,并使得这一计划提前出色完成,引起世界的震惊。曙光3000也由于又一次担当国家重任而成为我国水稻基因测序的功臣
2000年5月11日,中国超级杂交水稻基因组计划在北京空港工业区正式启动。水稻基因组作为迄今进行的植物基因组测序中最大的项目,其基因数占到了人类基因组的七分之一,系统庞大的基因组研究犹如一架巨大的机器,每一个参与的因素都成为这部机器上的一个部分,相辅相成,缺一不可。在水稻基因的关键应用上曙光超级服务器发挥了不可取代的作用,2000年底,测序到生物信息分析进展到一个新的阶段,而此时服务于项目的计算机的容量和相应软件却显示出明显的不足,测序工作一度暂停。经多方协商,2001年4月,国内运行次数最高的超级服务器"曙光3000"计算机紧急运送到设在杭州的华大基因中心,有了每秒运算次数千亿次以上的曙光超级服务器的支持,科研人员终于把目标瞄准了杂交水稻"父本"。
水稻基因组研究在农业生产上的意义,可与人类基因组计划对人类健康的意义相媲美。中国科学院基因组生物信息学中心主任杨焕明教授说:"这一成果由我国科学家独立完成,其意义非比寻常。它标志着我国已经成为继美国之后第二个具有独立完成大规模基因组测序和组装分析能力的国家。"曙光3000的出色发挥,使华大基因中心以“法拉利跑车般的速度”在短期内就跻身全球基因测序的前列,展示了我国的科学实力,同时也显示出我国高性能计算机产业的实力。
据悉,"华大基因中心"采用了多台曙光超级服务器用于研究,在人类基因组“中国卷”的研究过程中,就是在曙光3000的稳定高速运行下完成的,此次在曙光3000的大力支持下,中国科学家又独立完成了一项世界级研究成果,率先完成并公布了水稻基因图。
曙光3000是国家863计划的重大成果,是我国高性能计算机领域中新的里程碑,标志着我国超级服务器的技术和产品已经走向了成熟。曙光3000的最高浮点运算速度达每秒4032亿次、内存总量达168GB,支持科学与工程计算、数据与事务处理以及网络信息服务。在整体上已经达到国际先进水平,机群操作系统等部分技术更达到国际领先水平。曙光3000超级服务器的研制成功,一举打破了外国对我国的技术及产品垄断,在国防及安全领域具有突出的战略性意义。作为我国发展民族高性能计算机产业的领头雁,以及高科技产业化的成功典范,曙光在发展民族高性能计算机产业、促进科研领域以及国民经济信息化的发展上,都将作出更大的贡献。
摘自 新浪科技