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利用炭疽杆菌基因组破案?希望渺茫
【字体: 大 中 小 】 时间:2002年05月13日 来源:
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[生物通讯]去年秋季的炭疽邮件袭击案中,美国联邦调查局(FBI)的调查人员没有抓到一个嫌疑犯--而旨在帮助调查人员破案而启动的炭疽杆菌基因组计划似乎也不太可能使案件的调查有什么大的突破。发表在《科学》杂志网络版上的一篇分析炭疽杆菌株系基因组的文章,为区分成百上千种的炭疽杆菌株系提供了新的标记,但文章中几乎没有任何暗示这些标记有助于FBI将攻击的杆菌株系与某一实验室联系到一起的字眼。
邮件中含有的炭疽杆菌株系名为艾姆斯氏(Ames),该株系是1981年在美国得克萨斯的一头死牛上收集到的,当时被送交到美国在马里兰州Fort Detrick的传染性疾病军事医学研究院,后来又转送至其它14个实验室。由于炭疽杆菌会随生长而发生突变,因而当前每一实验室中的株系都与其它株系略微不同。如果某一株系恰巧与进行恐怖袭击的株系--暂命名为佛罗里达株系吻合,那么就会为找到恐怖分子提供线索。
现在,马里兰州Rockville的美国基因组学研究院(The Institute for Genomic Research ,TIGR)的Timothy Read和他的同事测序了佛罗里达株系的基因组,并将之与所谓的宝顿(Porton)株系进行了比较。研究小组共发现38处与佛罗里达株系基因组的不同之处。为查明这些显著的遗传热点是否有助于区分其它炭疽杆菌株系,研究小组从不同实验室收集了4个隔离的艾姆斯氏株系;从得克萨斯的一头死山羊体内收集一个艾姆斯氏株系;并从牲畜体内收集了两个非艾姆斯氏株系。研究人员确定所有38个标记上在每一株系中的确切序列。虽然这些标记能够清楚地区分出死亡动物中的炭疽杆菌样品,但比较结果显示,4个来自实验室的株系彼此以及与佛罗里达株系之间似乎完全一致。
理论上,如果对15个实验室的所有艾姆斯氏株系都进行同样的38标记检测,应该出现更多的变异。但目前为止发现的差异如此之少,因而这种方法希望渺茫,密切注意着联邦调查局的调查工作的美国科学家同盟之化学与生物武器控制计划的主任Barbara Hatch Rosenberg认为。但TIGR认为,即使该计划没有立即的回报,也可为将来在微生物基因组比较上取得突破做出贡献。
生物通摘译自SCIENCE NOW