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天蓝色链霉菌测序完成,有望成为新抗生素开发工具(附图)
【字体: 大 中 小 】 时间:2002年05月10日 来源:
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[生物通讯]大自然最全能的抗生素生产者令人炫目的水底生活在近日举行的英国皇家机构会议上揭开神秘面纱。一组科学家宣布,他们完成了最常见的土壤细菌--天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)基因组,也是迄今最大的微生物基因组的测序工作,该基因组中蕴藏着令人惊奇而又大有前途的基因组特征。现在,科学家们力图将该细菌转化成更佳的药物开发工具。
S. coelicolor是生产三分之二用于医药的天然抗生素以及共9000余种具生物活性物质的链霉菌大家族中的一员。不同于其它种类的细菌,链霉菌长成细丝状菌落,象多细胞生物体一样发育出专门的“组织”。链霉菌繁殖前,会生产出更多的抗生素以抵御竞争者。这恰恰是科学家想要针对抗药性细菌所采用的策略。
来自英国John Innes中心和Sanger研究院的研究人员彻底探查S. coelicolor的基因组后,共发现7825个可疑基因。有关S. coelicolor基因组的分析研究发表在5月9日期的《自然》杂志上,文章还描绘了3种迄今未知抗生素的装配线蓝图,这3种抗生素一旦被识别,就可作为药物开发中的启动化合物。
该链霉菌的基因组序列还为研究人员了解链霉菌的生活方式提供了新的线索。不同寻常的是,天蓝色链霉菌许多基因编码的是有助于运输材料进出细胞的蛋白质,这使得天蓝色链霉菌成为可以应付多种土壤条件和食物来源的“多面手”。也许最令人惊异的当属发现了一组正常条件下编码用于形成气囊(gas vesicle)蛋白的基因,气囊通常被水生细菌用作产生浮力。John Innes中心研究S. coelicolor已有40多年历史的退休教授David Hopwood认为,编码气囊蛋白基因的发现是“最最奇妙的事情。”他推测,气囊有助于链霉菌的孢子生存于富氧的湿地土壤表面。
John Innes中心的另一位研究人员Mark Buttner现在正协调一项230万美元的研究项目,旨在把天蓝色链霉菌转化成药物开发的有效工具。他表示,经过特别设计的链霉菌株系可以使研究人员将链霉菌以及其它细菌生产的各种基础抗生素结合起来,制成新型的混合抗生素。
生物通摘译自SCIENCE NOW