基因组学里程碑:首张人类全基因组芯片问世(图)

【字体: 时间:2003年10月08日 来源:

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[生物通讯]上周,商业基因组学迎来了一个里程碑时刻,几家公司正争相分享这一荣誉。设在加州Santa Clara的生物芯片业领头羊Affymetrix公司宣布开始销售世界上第一个含有人类基因组整套50,000个候选基因的芯片。这个注册商标为“GeneChip”的微阵列能测定一个生物样本中所有已知人类基因的活性。

除人类外,还有另外5种生物已存在全基因组芯片,它们分别为酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、线虫(Caenorhabditis )、果蝇、拟南芥和大肠杆菌。这些全基因组芯片使大规模扫描这些物种中出现的新基[AD340X300]因修饰和变异成为可能,现在人类全基因组芯片的问世使全面扫描人类基因变异也成为可能,加州Salk生物学研究所的植物科学家Joseph Ecker认为。Ecker是拟南芥全基因组芯片研制的先锋之一。

除Affymetrix外,加州的另一家公司安捷伦科技也开始销售自己的人类基因组芯片,这些芯片是作为实验原型。自今年6月起,威斯康辛州麦迪逊的NimbleGen Systems公司在冰岛的实验室已开始用另一个全基因组芯片来支持DNA扫描仪器。一个芯片的价格一般不到$1000,而一个读取芯片杂交数据的芯片扫描仪通常售价为$100,000甚至更多。

这几家生物芯片制造商运用了多种不同的技术将微小的DNA样点附着到玻片、硅片或尼龙膜上。当样本中的RNA点到芯片上时,就会与芯片上序列匹配的DNA点结合。RNA有荧光标签,能标记出其附着的位置。根据RNA附着的位置和荧光信号密度,研究人员能判断出样本中的基因活性如何。

所有3家公司都缩小了芯片上DNA样点的大小,由此每个芯片上就可容纳更多的样点。“这些进步将会大大减少一次实验所需的时间和工作量,同时也节约了成本,并使数据更加统一。”Ecker说。尽量减少一次实验所需的RNA量是关键,因为有时研究人员只能分离出微量RNA,他补充说。。(生物通编译)

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