手机“下载”DNA--记无线基因组数据库

【字体: 时间:2003年02月27日 来源:

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    [生物通讯]现在,生物学家能够在灵感迸发的任何时候将其抓住了,这都得归功于一个可将遗传信息发送到手机上的新数据库。

    “我正坐在巴士上读《自然》杂志上的一篇文章,这时我突然想知道我阅读的这个物种有哪些DNA序列可以在公共数据库中获得。”瑞典斯德哥尔摩Karolinska研究所的基因组学研究人员Björn Ursing说。“然后我又看了看手中的手机。”

    Ursing意识到,使手机也能上网的无线应用协议(wireless application protocol ,WAP)解决了这个问题。现在,Ursing已经汇编了一个基于WAP的DNA数据库,里面汇集了所有117种基因组已被测序的生物的DNA序列信息。

    WiGID,即无线基因组信息数据库(wireless genome information database),含有物种的名称、科学描述和发表其遗传序列的参考文献。数据库中还含有DNA序列、[AD340X300]染色体和基因等基因组信息。

    除了有助于研究计划的编制外,WiGID还能够瞬时证实观点,平息争议。“我听说有人在讨论会上用它来核实发言人的讲话的真实性。”Ursing说。这个数据库于几周前启动,这个与已有超过一百名访问者。

    无线设备可以帮助研究人员跟上不断发展壮大的基因组数目,设在英国剑桥附近的医学研究委员会之基因组图谱项目资源中心的生物信息学专家Damian Counsell评价道。

    “随着基因组测序的频率越来越高,及时增加新物种的数据以更新数据库是必要的。”他说。

    手机和掌上电脑(PDA)的科学用途还处于探索阶段,芬兰Tampere大学的生物信息学家Mauno Vihinen 解释说。他从事BioWAP的研究,这是一个基因组和蛋白质数据库的无线搜索引擎。“人们对这些东西的存在可能感到有点吃惊。”他说。

    但他们很快就会对WAP、手机、PDA和个人电脑等设施的无所不在习以为常,Vihinen预言。“未来,将会有更多的无线通讯设施在实验室使用。人们将会随时接通。”

参考文献:

Ursing, B.WiGID: wireless genome information database. Bioinformatics, 19, 439 - 440, (2003).

生物通编译自NATURE SCIENCE UPDAE

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