[生物通讯]自7年前酵母基因组测序完毕以来，研究人员一直就哪种方法是识别“真正”基因－－即编码蛋白的DNA序列－－的最佳途径争论不休。现在，研究人员又测序完成了3个酵母基因组，他们声称目前的酵母基因列表需要重新修订。

通过比较新旧基因组序列，研究人员发现了将近50个新基因和70个基因调控序列。研究人员还提出，约有500个早先被认为是基因的DNA片段应该排除。

这项研究发表在最新一期的《自然》杂志上，它的意义远远超越了面包和啤酒：它可作为一个识别人类基因组中全部基因的模型。而且，许多酵母基因都有人类副本，包括一些在癌症中起作用的基因。

“这项研究表明了测序紧密相关物种的基因组是多么重要。”马里兰州基因组研究所（Institute for Genomic Research ，TIGR)的Steven L. Salzberg在随文发表的评论中说道。”如果我们把所有基因组都罗列出来，注意比较每一物种中的相同序列，这将会告诉我们哪些基因更重要。”

“这是我们需要对人类基因组所做、事实上也是正在做的研究。”他补充说。

当用于酿酒和面包的啤酒酵母Saccharomyces cerevisiae1996年被测序时，研究人员发现了近6000个可能的基因，这是根据序列长度和指示基因起止位置的特殊信号判断的。随后的估计将数字锁定在4800到6400个基因之间。根据《自然》杂志的这篇新研究，啤酒酵母确切的基因数目应该是5,538。

在这项新研究中，Whitehead研究院Eric S. Lander实验室的研究生Manolis Kellis和他的同事分析了3个其它酵母物种的基因组并与S. cerevisiae做了比较。

“对于每一个可能的基因序列，我们都检查是否存在进化压力来保留这个DNA片段。”Kellis说。“我们排除了约500个在进化上不保守的序列。进化没有理由照顾这些序列。”

对Kellis自身而言，这项研究最令人激动的发现是找到了70多个调控基因活动的新序列。

“我们发现了两种调控序列。”他说。“一些序列扮演着小小的交通信号灯似的角色，告诉基因何时打开何时关闭。还有一些序列则像是邮政编码或货运地址，它们告诉细胞一旦基因被转录为RNA时，应将信息发送到哪里。”

研究人员还发现，酵母基因最大的变异发生在染色体末端，也就是所说的端粒区域。端粒在人类基因组中还未被完全测序。

“端粒部位的DNA交换要快速和频繁得多。”Salzberg说。“我认为有25％的可能性同样的情况也发生在人类基因组中。让我们拭目以待人类基因组端粒的测序结果吧。最有可能出事的地方，就是基因重排最有可能发生的地方。”

“我们需要完成对人类基因组最有一个碱基的测序才能知道答案。”他补充说。（生物通编译）