GeneSweep:人类基因数“彩票”开奖

【字体: 时间:2003年06月04日 来源:

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[生物通讯]人类基因组已经测序完毕,但计算人类基因组所含的基因数目还需要更多的时间。不过DNA专家们已确定谁做的预测最准确:Lee Rowen(左图)。这名西雅图测序专家和她的两位同事本周被宣布为的GeneSweep“彩票”得主。这是3年前在冷泉港实验室举行的一次基因组会议上开始的一次非正式竞赛,研究人员各自猜测人类基因组中含有多少个编码蛋白质的基因。

当英国剑桥附近的欧洲生物信息学研究所的Ewan Birney组织这次竞赛时,他就相信答案到2003年时可以确定。当时的大多数估计数字都过高。一些专家的估计数字为70,000 到100,000个基因。只有少数研究人员猜测实际基因数可能只有一半甚至更少。

随着测序专家们越来越接近完成人类基因组计划,估计数字不断降低。例如,Birney估计根据今天严格的标准和改进的基因预测程序,人类基因组可能只含有24,500[AD340X300] 个基因,其中3000个可能还是不编码蛋白质因而不应计算在内的假基因。但还有相当一部分研究很不透彻的被称为“黑质”的DNA序列,它们中可能含有更多基因。面对这种复杂性,Birney认为必需推迟GeneSweep得主的选举。

但随后他又决定,无论如何,“我们的测序结果已说明人类基因数低于30,000个,”他在上周与冷泉港实验室举行的基因组研讨会上说。而只有少数打赌者将赌注押在这么低的数字上。而华盛顿西雅图系统生物学研究所的测序专家Rowen预测的数字最为接近,她2001年预测人类基因数为25,947个。因此Birney决定将赌金中的一半颁给Rowen,另一半由英国医学研究委员会的Paul Dear和法国enoscope公司的Olivier Jaillon分享。 Dear在2000年预测人类基因数为27,462,Jaillon2002年预测基因数为26,500。

Rowen把她的准确预测归功于Genoscope公司的测序专家Jean Weissenbach的影响;几年前,他就认为人类基因数可能不多。“那时,当听到我的预测数字时,所有人差点从椅子上跌落下来。”Rowen回忆说。但现在已无可否认人类的蛋白质编码基因数目与线虫和果蝇的数目相近。(生物通编译)

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