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聚焦细菌进化史
【字体: 大 中 小 】 时间:2003年08月11日 来源:
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[生物通讯]尽管5年前进化生物学家还持悲观态度,但根据一项新研究,绘制出昆虫的系谱实际上是可能的。20世纪90年代后期,基因组测序开始发现,许多基因通过“横向转移”从一个物种跳到其它物种,这种跳跃有时甚至发生在亲缘关系很远的物种之间。这种基因混合使得一些杰出的进化生物学家得出这样的结论:细菌的进化史更像是纠缠交错的葡萄藤,很难--如果不是不可能--查清它们的祖先是谁。
几十年前研究人员就已经知道细菌能够接纳新基因,可能是通过吸收环境中的DNA,或者吞噬或合并其它细菌。在过去几年里,对新测序的细菌基因组的分析揭示,细菌之间存在更为广泛的基因跳跃。亚里桑那大学的进化生物学家Vincent Daubin、Nancy Moran和 Howard Ochman决定评估这些外源基因是否真的使构建昆虫的进化树成为不可能。现在,他们在8月8日期的《科学》杂志上报道,他们识别出许多与自己的基因组“生死与共”的基因,足以使细菌分类切实可行。
三人寻找了一些亲缘关系很近的细菌物种所共有的基因。对于这些物种,其进化史已知是根据核糖体RNA的研究确定的。根据共有基因序列中的差异,研究人员构建出已确立进化关系的基因树。根据比较的细菌组有多达1589个基因树与根据核糖体RNA构建的进化树相匹配。基因树错误地将不同物种混淆--这是基因横向转移的标记--的例子十分罕见。
但这篇文章遭到批评。加拿大哈利法克斯加的Dalhousie大学的进化分子生物学家W. Ford Doolittle认为研究小组“在模拟横向转移的影响方面太离谱了。”还有一些科学家则认为这个研究结果可能不适用于亲缘关系很远的物种。但也有生物学家很看好这种细菌系谱的前景。“我认为描绘细菌的系谱要比描绘鸟类或蟾蜍的系谱更难,但并非不可能。”纽约州立大学的微生物群体遗传学家Daniel Dykhuizen称。(生物通编译)