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假单胞菌的基因组测序完成
【字体: 大 中 小 】 时间:2003年08月15日 来源:
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[生物通讯]康奈尔大学的研究人员完成了一种主要植物病原体的基因组测序,为减少农业损失、甚至减少人类和动物的感染提供了新方法。
根据康奈尔的植物病理学教授Alan Collmer博士,这个细菌序列的测定将有助于农民防治番茄斑萎病和其它植物病害。医学研究人员还可以将这个序列与另一种引起致病肺部感染--囊性纤维化的近源细菌进行比较。环境科学家从中也可获得了解另一近缘细菌如何能够在土壤中生存、吸收有毒废物的新工具。
康奈尔大学和美国基因组研究所(The Institute for Genomic Research ,TIGR)的研究人员将假单孢菌(Pseudomonas syringae,DC3000菌株)的测序结果发表在8月18日期《美国科学院院刊》(PNAS)的网络版上。P. syringae的基因组对于研究引起致命肺部感染--囊性纤维化和癌症病人急性感染的一个近亲细菌P. aeruginosa将会有所帮助,研究的主要作者Collmer称。比较这两个细菌的基因组将有助于研究人员了解这些细菌是如何使用宿主的,揭示可用作治疗新靶点的细菌弱点。
“对这个细菌的基因组的了解将把我们引向更大细菌病原体王国。”Collmer说。“假单胞菌已成为植物病理学研究的一个首选模型。这个基因组揭示了植物的发病机制是多么复杂。”
这个计划由美国国家科学基金会植物基因组研究计划资助。TIGR的生物学家C. Robin Buell是计划的领导人。许多动植物的病原菌--包括瘟疫致病菌鼠疫杆菌(Yesinia pestis)等都是利用叫做“III 型分泌系统”的机制将病毒蛋白注入健康的宿主细胞中。研究人员通过与康奈尔大学理论中心的计算生物学家Samuel Cartinhour 和美国农业部农业研究机构的David Schneider合作,在假单胞菌中发现了编码超过35种注入宿主细胞内的病毒蛋白的基因,比任何其它已知病原体都要多。
P. syringae是农业上的一种重要病原菌,引起番茄的细菌性褐斑病。虽然科学家已经找到了一些抗假单胞菌病害的办法,但随着时间的推移,病原菌对这些方法都产生了抵抗力,这次假单胞菌的测序完成将为防治有关病害提供新的思路。(生物通讯)