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文特尔率先公布狗基因组序列图(图)
【字体: 大 中 小 】 时间:2003年09月26日 来源:
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[生物通讯]“影子”正在一点点长大。9岁的时候,他的毛由黑色变成了灰色,他最喜爱的消遣就是吃。
但这只普通的狮子狗无疑将在科学史上占有一席之地:他是最新一只基因组被测序完毕的动物。影子的主人是大名鼎鼎的克雷格·文特尔,--人类基因组测序私人基金计划的领导者,他用自己的DNA为材料完成了人类基因组图谱。
影子的序列图将有助于科学家寻找人类基因,了解癌症、癫痫、嗜睡病和强迫症等[AD340X300]疾病。这个图谱还有助于培育出更健康的狗品种以及追溯狗的进化史。
这个新序列图揭示,狗基因组中有18,473 个基因与人的基因同源。这个数字超过了小鼠基因组的18,311个人类同源基因。研究人员还发现了与狗的生活特点有关的基因:它们的嗅觉相关基因比我们人类的要多得多。
但这个狗基因组序列图与小鼠和人类的基因组图谱比起来,还不太完整。“我们得到许多序列片段,事实上大概有2百万个片段,只覆盖了影子基因组的80%。”该计划的领导人、马里兰州基因组学研究所的Ewen Kirkness说。
但马里兰州美国国家癌症研究院的基因组研究人员William Murphy认为,粗略的调查也能提供丰富的信息。“虽然覆盖率相对较低,但测序结果还是非常不错的。”他说。这种快速测序技术也可用于其它不值得进行完整基因组测序计划的物种。
同时,美国政府资助的计划正在致力于完成详细的狗基因组图谱,实验材料是一只名为Tasha的拳师犬。该计划预计于今年底或明年初完成。拳师犬是遗传变异最少的狗品种之一,因此它的序列可作为可靠的参照序列。
狗基因组有24亿个碱基对,而我们人类有29亿个。狗有39对染色体,人类有23对。同一物种不同品种间超过99%的序列都是相同的。
大多数人类疾病都有对应的狗疾病。狗的体积生活方式和生命期等与啮齿类动物相比,都更贴近于人类,康奈尔大学的狗遗传学家Gregory Acland 说。他在其眼病研究中已经用使用了影子的序列。
目前已知的狗遗传病有350多种,超过了除人类之外的所有动物。例如,约有10%的爱尔兰赛特猎狗携带一种免疫疾病的基因。育种学家可通过DNA检测避免该基因携带者参与交配。这个狗基因组图谱将加速寻找这样的基因的步伐,英国狗俱乐部的首席遗传学家Jeff Sampson表示。
这个基因组图谱还有助于揭示过去一个世纪以来不同狗品种间是如何演化的,Sampson说。比较品种间的微小差异可以解释为什么牧羊狗如此擅于放牧,而警犬的嗅觉为何如此准确。(生物通编译)
参考文献:Kirkness, E. F. et al. The dog genome: survey sequencing and comparative analysis. Science, 301, 1898 - 1903, (2003).