可以预测DNA构象变化的软件

【字体: 时间:2004年06月01日 来源:

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生物学家习惯将DNA  序列以字母A、C、G、T表示,而串行成典型的双螺旋结构中。但是DNA也具有机械特性,从而影响基因的开启及关闭。

根据加州大学戴维斯分校基因组中心的研究人员表示,他们开发出一种软件,将可以预测DNA  分子将于何处开启及何时扭转。这个程序有助于解释基因在各种的情况下如何开启或关闭。DNA  在活细胞中多半因为张力而分别以二个不同的方向扭转。这种扭转方式可以使两条螺旋容易地展开,而使DNA可以被复制或读取。当DNA  展开时,它从其它地方释放压力,而使某个位置开启或关闭。

DNA扭转的压力会受到环境状况影响,如食物短缺等因素。这将影响细胞如何对环境做出反应。酶蛋白解开DNA,使基因可以复制并利用这个扭转的影响而向前推挤过度扭转的波浪。  

这篇研究发表于5月号的Bioinformatics中。这种预测工具称为WebSIDD,可以于网络上取得。其它与WebSIDD有关的资料请见:http://www.genomecenter.ucdavis.edu/benham/index.php

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