简便灵敏、高通量的mRNA检测技术
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时间:2008年02月20日
来源:生物通
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美国的一家公司最近在《 Nature Biotechnolog y》发布一项新的mRNA检测技术。该技术利用彩色的“标签”来实现简便、高效、灵敏检测基因表达转录本的目的,其灵敏度比芯片高,与实时PCR的相当。该技术将大大方便科学家同时对许多功能相关或有某种联系的基因的检测。
生物通报道:美国华盛顿大学和NanoString公司的研究人员在2月17日的《Nature Biotechnology》描述了一种叫做NanoString nCounter基因表达系统的技术,该技术能够捕捉和计算每个mRNA转录本。与现有mRNA检查平台相比,它的优势在于直接测量mRNA的表达水平,无需进行复杂的酶催化反应;高通量,高灵敏度,结果偏差较小;处理样品的容量高;能够直接读出数字结果。 该技术的核心是各种不同的“标签”,这些标签能够能够结合到复杂生物样品的各种特异分子上,并在不同的位置产生不同的彩色光。用nCounter系统对509个人类基因的表达进行测试,结果的重复相关系数为0.999,检测极限为0.1 fM至0.5 fM,线性动态范围超过500倍。用nCounter系统和芯片、TaqMan PCR等mRNA检测方法比较,发现它的灵敏度比芯片高,与实时PCR的相当。最后,研究人员分别用nCounter系统和SYBR绿色荧光PCR同时对7个样品的21个基因的转录本含量进行检测,结果显示所有基因的转录本水平都相似。 由于在分子生物学的研究中,经常要同时对许多功能相关或有某种联系的基因同时进行转录的检测,因此科研人员非常希望有一种简便、高效、灵敏的检测方法,来代替较为繁琐的芯片和RT-PCR等方法,这个基因表达的检测系统也许能够满足这个需求。(生物通,揭鹰) Gary K Geiss et al. Direct multiplexed measurement of gene expression with color-coded probe pairs. Nature Biotechnology Published online: 17 February 2008 | doi:10.1038/nbt1385
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