研究指出，新的基因发现是生产低成本纤维素乙醇潜力的关键，美国能源部橡树岭（Oak  Ridge）国家实验室的科学家于2010年5月29日宣布，正在改善用于转化纤维素生物质成为乙醇的微生物菌株性能，包括最近的改进可望提高转化过程效率。

        生物燃料研究和工业人员已发现了改进的突变微生物，首次采用这些菌株提高了过程效率，并有潜力可用于生产更具成本效益的生物燃料。

        目前，一些生物质材料像谷物秸秆和柳枝稷必须经过一系列的预处理才能破解由细胞组成的结构，以便从纤维素中抽取糖类。但是这些处理帶来新的挑战，因为，虽然预处理有必要，但它们会形成宽范围的化学品，作为抑制剂，会阻止微生物发酵。

        有两个途径，可解决这一困惑和抑制剂带来的困难，一个办法是去除抑制剂，但这种方法非常昂贵，也不有助于使生物燃料的生产成本与汽油相竞争。第二种方法是开发能更耐抑制剂的微生物。

        例如，非变异菌株Z.  mobilis在抑制剂醋酸酯.  Z存在下就不能生长。但是，当通过将含有基因的DNA段插入非变异菌株来表达时，这种细菌就能在这种环境中承受醋酸酯。

        研究人员已发现这种基因并将其组合到酵母菌株中，从而改善了酵母。突变基因的组合可减少特定抑制剂的不良影响，使加工生物质生产乙醇具有良好潜力。

        橡树岭国家实验室的微生物学家也正在检测用于生产生物燃料的其他微生物，如果通过改变基因使其能耐不同类型的抑制剂，则也具有优点。