四川农业大学动物遗传育种研究所本月初在国际知名期刊PLoS ONE上发表了题为“MicroRNAome of Porcine Pre- and Postnatal Development”*的研究论文，首次全面系统地阐述了猪从出生前到出生后整个发育阶段的microRNA组（MicroRNAome）图谱。此项研究由四川农业大学李学伟教授（通讯作者）和李明洲博士（第一作者）领导的课题组与美国休斯顿大学，LC Sciences公司等机构的科研人员合作完成。

猪（Sus scrofa）早在9000年前就已被人类驯养，作为重要的食物蛋白质来源，由于其个体大小，解剖学，生理学，新陈代谢，病理学以及药理学上与人十分相近，现已成为一种重要的研究人类疾病的模式动物，将来有可能成为人类异种移植的重要器官来源。microRNA（miRNA）作为一类长度约为22 nt的非编码小RNA，已被大量实验证实是一种重要的基因表达调控因子。miRNA通过抑制mRNA翻译或是引起mRNA降解来实现其对基因表达的调控。然而，相比于人microRNAome，猪的miRNA研究严重滞后。在Sanger miRBase 15.0版中，人miRNA序列已超过900条，而猪miRNA序列仅有175条。

为了广泛深入地发掘猪microRNAome图谱，该研究收集了从胚胎到成年共计10个发育阶段的样品，覆盖了猪发育的全部代表性时期，采用Solexa深度测序技术（由LC Sciences公司提供技术服务）分别对10份样品进行miRNA序列的深度测定，总共获取了超过93.6M的序列读数。课题组使用LC Sciences开发的分析软件ACGT101-miR对测序数据进行了深度发掘。通过与哺乳动物成熟体miRNA序列，前体发夹序列（pre-miRNA），首次发布的猪基因组序列（Sscrofa9，April 2009），以及EST序列的精细比对分析，课题组对猪microRNAome数据库进行了大幅更新，pre-miRNA序列增至867条，编码的成熟体miRNA序列增至1004条，其中特异miRNA序列达到777条。研究人员选择了测序得到的30条miRNA，采用实时荧光定量PCR（qPCR）对猪的47个不同类型的组织样品进行检测，定量结果与测序结果一致。科研人员对测序得到的猪microRNAome进行了详尽的生物信息学分析，提供了有关miRNA的末端序列变异，miRNA前体结构，染色体定位，特定发育阶段的miRNA表达，以及miRNA保守性等详细信息。

此项研究受到了国家转基因生物新品种培育科技重大专项和国家自然科学基金的资助，是迄今对猪microRNAome图谱进行的最全面最详实的探索（包括miRNA和其异构体（isomiR）），归纳整理了大量猪miRNA的特征。此项研究成果的发表将大大促进猪生物学的发展，也必将促进以猪作为模式动物进行人生物学和生物医学的研究。

*Li M, Xia Y, Gu Y, Zhang K, Lang Q, et al. (2010) MicroRNAome of Porcine Pre- and Postnatal Development. PLoS ONE 5(7), e11541. 下载原文>>

关于LC Sciences与联川生物
LC Sciences（美国）是一家专业提供基因组及蛋白质组产品与服务的生物技术公司，提供全方位的DNA，RNA及多肽微阵列服务，深度测序服务，生物标记发现和新药筛选，研发应用于诊断和生物传感的微型实验设备。基于专利的µParaflo®微流体技术，LC Sciences可提供具有高度灵活性和定制化的创新产品来满足客户快速变化的需求。联川生物作为LC Sciences在中国成立的全资子公司，随时为您提供最新的生物技术服务和前沿信息。

欢迎拨打免费咨询热线：800-857-1452

更多LC Sciences 深度测序服务信息，请浏览: http://www.lc-bio.com/products/products_show.asp?id=466 ，或点击此处索取资料。

打赏

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析！

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》