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周钢桥研究员最新Nature Genetics文章解析癌症易感基因
【字体: 大 中 小 】 时间:2010年08月04日 来源:生物通
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来自解放军军事医学科学院,南京医科大学,中国医学科学院肿瘤研究所,复旦大学,中山大学肿瘤医院等处的研究人员在人类染色体的特殊位置发现了一个容易导致肝癌的易感基因区域。这一重大发现不但有助于科学家们深入解析肝癌的发病机制,而且为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗以及新型高效药物的筛选提供了理论依据和生物靶标。这一研究成果公布在《Nature Genetics》杂志上。
来自解放军军事医学科学院,南京医科大学,中国医学科学院肿瘤研究所,复旦大学,中山大学肿瘤医院等处的研究人员在人类染色体的特殊位置发现了一个容易导致肝癌的易感基因区域。这一重大发现不但有助于科学家们深入解析肝癌的发病机制,而且为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗以及新型高效药物的筛选提供了理论依据和生物靶标。这一研究成果公布在《Nature Genetics》杂志上。
肝癌仍是目前临床上治疗效果最不理想的肿瘤之一。中国是肝癌高发国家,每年新发病例30万,占全球肝癌新发病例的半数以上。超过80%的肝癌与慢性乙型肝炎相关,然而,乙型肝炎患者中只有一小部分个体最终罹患肝癌。科学家们因此推测,这种个体间肝癌发生率的差异可能与机体的易感基因密切相关,以往虽有单个基因的易感性研究,但一直缺乏全基因组规模的易感基因系统筛查。
为全面确定肝癌的遗传易感基因,这一项目主持人、论文责任作者周钢桥研究员带领的课题组联合国内10多家医院和研究所,招募了中国大陆5个肝癌高发区的4500多名肝癌病例和对照,通过全基因组关联分析,从整体基因组水平进行系统研究。经过近两年“大海捞针”式的艰辛搜寻,终于在全基因组30亿碱基中发现一个长度为24万碱基的肝癌易感基因新区域染色体1p36.22,包含UBE4B、KIF1B和PGD三个基因,提示这些基因的相关通路参与了肝癌的发病机制。研究同时表明,如果该基因组区域发生变异,会使人更容易患肝癌。
周钢桥研究员介绍,这是国际上第一项关于肝癌的全基因组关联研究。全基因组关联研究技术是目前科学界公认的行之有效的系统搜寻重大疾病易感基因的最尖端研究方法,曾列《科学》杂志评选的2007年十大科学进展的第一位。此前,欧美多国利用全基因组关联研究技术已经发现了近70种重大疾病的易感基因,在国际上掀起了新一轮疾病基因的研究热潮,但由于种种原因,中国科学家在这一举世瞩目的重大疾病易感基因"地毯式掘金浪潮"中几乎集体"失声"。这项研究成果的发表,发出了中国科学家在人类重大疾病易感基因研究领域的最强音。
据了解,南京医科大学、中国医学科学院肿瘤研究所、复旦大学、中山大学肿瘤医院和广西肿瘤医院、广西扶绥肝癌研究所、江苏海门市疾控中心等单位的100余位科研人员参与了本项研究的协同攻关,所有科研人员均是清一色的大陆本土专家。这项研究得到了国家863计划、国家传染病重大专项和国家自然科学基金的资助。
据论文第一作者张红星博士介绍,目前发表的肝癌易感基因位点1p36.22只是这项全基因组关联研究项目的第一批阶段性成果,还有其它新的肝癌易感基因正在加紧实验验证,有望在近期内取得系列新的重要进展。
原文摘要:
Genome-wide association study identifies 1p36.22 as a new susceptibility locus for hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis B virus carriers
To identify susceptibility variants for hepatitis B virus (HBV)-related hepatocellular carcinoma (HCC), we conducted a genome-wide association study by genotyping 440,794 SNPs in 355 chronic HBV carriers with HCC and 360 chronic HBV carriers without HCC, all of Chinese ancestry. We identified one intronic SNP (rs17401966) in KIF1B on chromosome 1p36.22 that was highly associated with HBV-related HCC and confirmed this association in five additional independent samples, consisting of 1,962 individuals with HCC, 1,430 control subjects and 159 family trios. Across the six studies, the association with rs17401966 was highly statistically significant (joint odds ratio = 0.61, P = 1.7 × 10−18). In addition to KIF1B, the association region tagged two other plausible causative genes, UBE4B and PGD. Our findings provide evidence that the 1p36.22 locus confers susceptibility to HBV-related HCC, and suggest that KIF1B-, UBE4B- or PGD-related pathways might be involved in the pathogenesis of this malignancy.
作者简介:
周钢桥
功能基因组学研究室P.I.
北京蛋白质组研究中心研究员,博士生导师,理学博士。主要从事人类基因组多态性和中国人群常见复杂疾病(包括慢性HBV感染、SARS-CoV感染、脓毒血症、鼻咽癌和肝癌等)的遗传易感性研究。承担多项国家973、863和科技专项等课题。曾获“茅以升科学技术奖—北京青年科技奖”、北京市“科技新星”和总后勤部“科技新星”等称号,先后获军队科技进步一等奖和北京市科学技术一等奖各1项。申请中国发明专利8项。已在SCI杂志发表研究论文30余篇,其中以责任作者/第一作者在Nat Genet、Nat Protocols、Gastroenterology、Hepatology、Gut和Clin Cancer Res等国际核心刊物发表研究论文14篇,影响因子合计106。参编学术专著3部。担任Hepatology、Cell Res、《中国科学》和《遗传学报》等国内外10余家学术刊物的审稿专家。
研究方向:
中国人群复杂疾病的遗传易感性研究。
重点研究领域:
慢性乙型肝炎、肝癌、严重急性呼吸系统综合征(SARS)鼻咽癌和脓毒血症等的遗传易感性究。
重点技术服务项目:
聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法基因分型
实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)法基因分型
实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)法mRNA定量
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