昆明植物所植物基因组学研究最新进展

【字体: 时间:2011年10月08日 来源:生物通

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  近日来自中国科学院昆明植物研究所的研究人员在基因组学领域专业期刊BMC genomics杂志上发表了题为“ Analyses of the oligopeptide transporter gene family in poplar and grape”的研究论文。

  

生物通报道  近日来自中国科学院昆明植物研究所的研究人员在基因组学领域专业期刊BMC genomics杂志上发表了题为“ Analyses of the oligopeptide transporter gene family in poplar and grape”的研究论文。

中国科学院昆明植物研究所、青藏高原研究所昆明部杨永平研究员与胡向阳研究员、美国东卡罗来纳州立大学的黄锦岭教授与江苏大学的曹军博士为这篇文章的共同通讯作者。

寡肽是一类由几个氨酸酸缩合成的短肽, 寡肽不仅可以作为生物体物质能量代谢所必需的碳源或氮源,它本身也可以作为信号分子发挥多种生物学功能,而寡肽转运体的主要功就是高效地将寡肽从胞外转运到胞内。寡肽转运体的研究相比集中在细菌与动物方面,植物寡肽转运体的相关研究相对较少。

在这篇文章中,研究人员报告了近期对于杨树葡萄中的寡肽转运体基因家族展开的基因组学研究的新成果。进化树分析表明杨树与葡萄中的OPT家族基因明显呈现出两个分枝,进一步可以细化成十个分枝; OPT家族基因在染色体中呈现非随机的串联重复方式分布,暗示基因重复在杨树与葡萄中适应性进化中的重要作用; 基因芯片结果表明杨树与葡萄中的OPT家族基因参与了生长发育及多种逆境响应过程; 正选择分析表明整个OPT基因家族受到强烈的负选择,但是针对某些特定的位点,进化压力依旧表现出正选择,并且这些位点都是膜外或膜内,表明这种选择与环境适应之间的相关性。这些结果有助于我们进一步理解植物OPT基因家族的进化与功能适应。

作者简介:

杨永平

1982-1986 兰州大学生物学习,1986-1989 中国科学院昆明植物研究所攻读硕士学位;1989-1992中国科学院昆明植物研究所实习研究员,1992-1997中国科学院昆明植物研究所助理研究员,1999-2002中国科学院昆明植物研究所计划外事处处长,2002-至今中国科学院昆明植物研究所副所长,1997-2006中国科学院昆明植物研究所副研究员,2006-至今中国科学院昆明植物研究所研究员。

研究领域: 植物生态适应与植物资源利用

胡向阳

1973年7月生,博士,研究员,博士生导师,中科院项目“****”获得者,曾获中科院院长奖学金“优秀奖”。现正主持项目“****”分子生态学领域一项;自然基金项上项目两项。主展植物适应逆境环境以及进化的分子机制研究, 目前本研究组正在利用生物化学、遗传学以及生物信息学等各种手段,从表观遗传学、普通遗传学与蛋白组学三个层次解析青藏高原极端逆境生境下植物适应与进化的分子机制,克隆与分离重要功能基因或蛋白,我们的长期目标是将重要的被自然选择优化的基因运用到农作物中以提高作物的抗逆性与品质。
胡向阳博士多年来主要开展植物适应逆境环境以及进化的分子机制研究。在水稻的抗病机制研究中首先发现小分子化合物一氧化氮介导水稻的过敏性亲合反应,证实一氧化氮除了可以介导双子叶植物的抗病性反应,它在单子叶禾本科植物的抗病过程中也是一种十分重要的信号分子。利用特异真菌的细胞提取物直接刺激水稻也可以提高水稻的抗逆性,提出真菌细胞壁中多糖成分是一种重要的刺激原,相关研究工作在Journal of Plant Physiology、科学通报等杂志上发表并被多次引用。同时他们也发现多次小分子合物介导的植物抗逆性反应,特别是利用转基因技术过表达某些小分子RNA可以提高植物对盐、冷等逆境的适应性,相关研究工作正在进展中。在植物春化现象的分子机制研究中发现FRI蛋白(一种调控植物开花时间的基因)的多态型现象,即FRI蛋白通过这种蛋白序列上的不同来调控植物的开花时间以适应不同的逆境环境。在植物的向重性研究过程中发现一氧化氮可以介导植物根尖的向重性弯曲,相关研究工作发表在植物学知名刊物Plant Physiology上并被公认为是首次报道一氧化氨的这种新功能,相关研究论文被 Nature ( Cell Biology) 等刊物广泛引用,引用次数已超过90次以上。近年来,在食物过敏原及其检测分析上开展相关研究,与同行科研人员合作将杨树、梧桐、小麦,花生中相关的刺激过敏原进行原核与真核异源表达研究其致敏性机制,并利用转基因技术进行低致敏原作物新品种的分子育种。利用PCR、ELISA与胶体金技术开发高效快速分析检测食物过敏原与转基因食物的新方法。
目前,已发表的文章有28篇。
 
研究领域: 植物抗逆分子生理

 

 

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