张亚平院士新文章解析家犬起源

【字体: 时间:2011年12月22日 来源:生物通

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  近期来自中科院昆明动物研究所的研究人员基于父系遗传证据首次揭示了现代家犬的起源,相关“Origins of domestic dog in Southern East Asia is supported by analysis of Y-chromosome DNA”论文近期发表在《Heredity》上。

  

生物通报道 近期来自中科院昆明动物研究所的研究人员基于父系遗传证据首次揭示了现代家犬起源,相关“Origins of domestic dog in Southern East Asia is supported by analysis of Y-chromosome DNA”论文近期发表在《Heredity》上。

领导这一研究的是昆明动物研究所张亚平院士,其早年毕业于复旦大学生物系,1991年获中国科学院昆明动物研究所博士学位,在他37岁的时候成为了中国科学院院士。主要的研究包括在国内较早地、系统地开展动物分子系统学的研究,深入研究灵长类、食肉类、兔形类和啮齿类的进化,在国际上建立了较为全面的熊超科分子系统树等。

过去基于母系遗传的分子标记线粒体DNA(mtDNA)的研究表明,全世界的家犬都主要由亚洲长江以南的灰狼驯化而来。另一方面,考古学和常染色体SNP的研究结果却支持家犬起源于欧洲或西亚。但是,由于常染色体SNP研究缺乏长江以南这一关键地区的数据,其结论难以令人信服。因此增加新的分子标记对世界范围内包括亚洲长江以南的家犬样品进行研究,对于验证mtDNA系统地理学的研究是否真实反映了家犬的驯化历史而不仅仅是随机事件或自然选择是非常必要的。

在这篇文章中,昆明动物研究所张亚平院士研究组与瑞典皇家理工学院Peter Savolainen教授研究组展开合作,对来自世界范围的151只雄性家犬的26个Y染色体特异区段进行系统的DNA序列分析。结果发现,世界范围内家犬共享约50%的基因库;其中,亚洲长江以南地区的家犬具有最高的遗传多样性,并涵盖了所有的主体单倍型,说明其它地区的基因库都来源于该地区。另外,这151只家犬来源于13-24个灰狼父系建群者,并没证据显示有驯化后的家犬与灰狼的杂交建群者存在。

新研究表明现代世界各地的家犬都主要起源于东亚南部地区的灰狼。该研究是首次基于父系遗传证据证明了证明了现代家犬的东亚南部起源,支持了线粒体母系遗传的研究结果。

(生物通:何嫱)

生物通推荐原文摘要:

Global mitochondrial DNA (mtDNA) data indicates that the dog originates from domestication of wolf in Asia South of Yangtze River (ASY), with minor genetic contributions from dog–wolf hybridisation elsewhere. Archaeological data and autosomal single nucleotide polymorphism data have instead suggested that dogs originate from Europe and/or South West Asia but, because these datasets lack data from ASY, evidence pointing to ASY may have been overlooked. Analyses of additional markers for global datasets, including ASY, are therefore necessary to test if mtDNA phylogeography reflects the actual dog history and not merely stochastic events or selection. Here, we analyse 14 437 bp of Y-chromosome DNA sequence in 151 dogs sampled worldwide. We found 28 haplotypes distributed in five haplogroups. Two haplogroups were universally shared and included three haplotypes carried by 46% of all dogs, but two other haplogroups were primarily restricted to East Asia. Highest genetic diversity and virtually complete phylogenetic coverage was found within ASY. The 151 dogs were estimated to originate from 13–24 wolf founders, but there was no indication of post-domestication dog–wolf hybridisations. Thus, Y-chromosome and mtDNA data give strikingly similar pictures of dog phylogeography, most importantly that roughly 50% of the gene pools are shared universally but only ASY has nearly the full range of genetic diversity, such that the gene pools in all other regions may derive from ASY. This corroborates that ASY was the principal, and possibly sole region of wolf domestication, that a large number of wolves were domesticated, and that subsequent dog–wolf hybridisation contributed modestly to the dog gene pool.

作者简介:

张亚平

院士,中共党员,理学博士,研究员,博士生导师。1991年在中科院昆明动物研究所获博士学位,1992-1995年初在美国圣地亚哥动物协会做博士后研究,1995年回国任研究员,现任中国科学院昆明动物研究所所长,中国遗传学会动物遗传专业委员会主任;《Cell Research》、《自然科学进展》、《遗传学报》、《科学通报》、《动物学报》、《生物多样性》、《动物学研究》等刊物编委。

他的研究小组主要从事进化基因组和基因组多样性研究,建立了广泛稳定的国际合作关系。他和合作者对哺乳动物重要类群的演化开展了系统深入的研究,澄清了一些类群系统与演化中的一些重要问题;在建立了东亚人群mtDNA单倍型类群的系统发育关系及基础上,探讨了东亚特别是中华民族的源流和人群的迁移与分化,提出了一些新观点;在我国系统研究了一些濒危动物和主要家养动物的遗传多样性;发现我国南方及周边地区是家养动物驯化的重要区域,证明遗传多样性的贫乏与物种濒危之间没有必然的对应关系;在脊椎动物中首次证明了微进化时间范围DNA进化速度有显著差异的现象,说明使用分子钟时应特别谨慎;深入开展了基因的起源进化和生物适应进化机制的研究,揭示了食物适应的一些遗传机制。1995年回国以来,在《Nature》、《Science》、《PNAS》、《Nature Genetics》、《American Journal of Human Genetics》等国际著名SCI刊物发表了一批论文,他们的论文已被引用约800次。因为在分子进化与遗传多样性方面的重要贡献,2002年荣获在美国颁发的国际大奖"Biodiversity Leadership Awards",成为第一位获此殊荣的亚洲学者。他还先后获得过中国青年科学家奖、中国青年科技奖等奖励。 2001年入选国家创新研究群体。他与美国、日本等国的多个实验室有长期的合作关系,并联合培养研究生。已招收培养了一批博士和硕士研究生。

目前主持在研若干项国家和省部级项目,包括国家自然科学基金委创新研究小组项目"分子进化与进化基因组" (360万),中国科学院重要方向研究项目"动物的种群遗传及其与生态适应的关系" (300万)等重大项目。

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