上海交大连发两篇Nature Genetics文章

【字体: 时间:2011年08月17日 来源:生物通

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  上海交通大学近期接连与国家人类基因组南方研究中心,安徽医科大学等处合作,发表了两项重要的成果:甲亢发病机制,以及特应性皮炎易感基因研究。

  

生物通报道:上海交通大学近期接连与国家人类基因组南方研究中心,安徽医科大学等处合作,发表了两项重要的成果:甲亢发病机制,以及特应性皮炎易感基因研究。

A genome-wide association study identifies two new risk loci for Graves' disease

来自上海交通大学医学院附属瑞金医院、国家人类基因组南方研究中心、徐州医学院附属医院、山东省临沂人民医院、蚌埠医学院第一附属医院等十几家医疗机构的研究人员利用先进的全基因组关联分析技术(GWAS)发现了Graves病(格雷夫斯氏病,简称甲亢,GD)的两个新易感基因位点。

文章的通讯作者是上海交通大学医学院附属瑞金医院的宋怀东教授、黄卫副教授、陈赛娟院士、陈家伦教授、陈竺院士以及宁光教授。其中宋怀东教授早年毕业于蚌埠医学院,现任上海交通大学医学院瑞金医院分子医学中心主任,医学基因组学国家重点实验室课题组组长。主要研究方向为脂肪组织的分泌功能及其与代谢综合征发生的关系。近年发表多篇重要成果,包括《Science》、《Nature Genetics》等国际一流刊物。

眼突、性躁、代谢快,严重时甚至引起心衰、昏迷——甲状腺机能亢进是一种常见病,以中青年女性多见,在我国该病患者约1400万人,且有逐年增高的趋势,其中90%属于自身免疫性甲状腺肿伴甲亢症(即Graves病)。

甲状腺刺激激素受体抗体(TRAb)是引起甲亢的元凶。它是针对自身甲状腺细胞表面的甲状腺刺激激素受体(TSHR)的抗体,与甲状腺刺激激素一样,会“催促”甲状腺分泌更多激素。但与甲状腺刺激激素不同的是,TRAb不听号令,毫无节制地刺激甲状腺,导致了甲亢。在正常情况下,TRAb本不该大量出现在人体中,然而在甲亢病人体内却似捅了马蜂窝,TRAb蜂拥而出,蜇在了甲状腺细胞上。为什么有的人体内会捅这个马蜂窝,而多数人不会呢?研究人员介绍说,这是因为遗传基因的不同起到了重要的作用。

为了解开这一疾病背后的谜团,在这篇文章中研究人员首先对3052名受试者(其中包括1536名Graves病患者,以及1516名未患该病的对照个体)进行了全基因组关联分析。在随后的研究中进一步对另一组7504名受试者(其中包括3994名Graves病患者,以及3510名对照个体)进行了检测,他们鉴定出了6个与Graves病相关联的风险位点,除了从前报道过的MHC、TSHR、CTLA4和FCRL3四个基因位点外,他们还发现了两个新的基因位点,一个是位于染色体上的6q27区域内的RNASET2,另一个是4p14区域内的GDCG4p14基因。

“这是一个非常有意思的发现,”南方中心执行主任、中科院院士赵国屏认为,这表明同样是甲亢,却可能由不同的基因而引起,“这就能解释为何治疗甲亢的常用药并非对所有患者有效。”

同病异治,这是中国人早在扁鹊时代就明白的道理,但真正实现却需要现代医学与基础研究不断结合与深入。内分泌专家、瑞金医院副院长宁光说,通过这项研究,了解到目前的治疗手段可能还不能适用于所有甲亢患者,针对相当一部分患者还需探索新途径。这项研究将可能为甲亢治疗方法的选择和预后的评估提供重要的生物标志。

Genome-wide association study identifies two new susceptibility loci for atopic dermatitis in the Chinese Han population

来自安徽医科大学,上海交通大学附属新华医院、德国基尔大学等国内外30多家单位联手攻关,发现了特应性皮炎易感基因。

特应性皮炎,又称异位性皮炎,是湿疹的一种特殊类型,好发于儿童,具有慢性复发,病程迁延,瘙痒剧烈,难以根治等特点,常伴发哮喘和过敏性鼻炎等自身免疫性疾病,且多数患者终身患病,对患儿的生长发育和成人的生活质量会造成严重影响,我国特应性皮炎的发病率约为3%。该病与遗传和环境因素密切相关,但具体病因不明。

这项研究前后历时3年多时间,采用全基因组关联研究方法,对近2万例特应性皮炎患者和健康对照者进行易感基因研究,在人类基因组2个区域内发现了与该病发病密切相关的4个易感基因,即5号染色体区域的TMEM232和SLC25A46;20号染色体区域的TNFRSF6B和ZGPAT;同时证实了既往在欧洲和亚洲人群中曾报道的易感基因FLG。研究发现,这些基因异常表现将导致特应性皮炎的发生。该研究实现了亚洲人群、欧美人群的国际性合作,突破了研究人群单一的局限,具代表性和科学性。

该研究得到了国家863计划、“973”前期研究专项、国家自然科学基金、安徽省财政厅和科技厅专项基金等的资助,是目前亚洲地区首个、全世界样本量最大的特应性皮炎全基因组关联易感基因研究,标志着我国在该病的易感基因研究方面跻身世界先进行列。该研究构建了第一个亚洲人群特应性皮炎病例—对照的全基因组关联研究数据库,为今后该病的深入研究,并最终全面揭示其发病机制奠定了坚实的基础。

原文摘要:

A genome-wide association study identifies two new risk loci for Graves' disease

Graves' disease is a common autoimmune disorder characterized by thyroid stimulating hormone receptor autoantibodies (TRAb) and hyperthyroidism. To investigate the genetic architecture of Graves' disease, we conducted a genome-wide association study in 1,536 individuals with Graves' disease (cases) and 1,516 controls. We further evaluated a group of associated SNPs in a second set of 3,994 cases and 3,510 controls. We confirmed four previously reported loci (in the major histocompatibility complex, TSHR, CTLA4 and FCRL3) and identified two new susceptibility loci (the RNASET2-FGFR1OP-CCR6 region at 6q27 (Pcombined = 6.85 × 10−10 for rs9355610) and an intergenic region at 4p14 (Pcombined = 1.08 × 10−13 for rs6832151)). These newly associated SNPs were correlated with the expression levels of RNASET2 at 6q27, of CHRNA9 and of a previously uncharacterized gene at 4p14, respectively. Moreover, we identified strong associations of TSHR and major histocompatibility complex class II variants with persistently TRAb-positive Graves' disease.

Genome-wide association study identifies two new susceptibility loci for atopic dermatitis in the Chinese Han population

Atopic dermatitis is a chronic, relapsing form of inflammatory skin disorder that is affected by genetic and environmental factors. We performed a genome-wide association study of atopic dermatitis in a Chinese Han population using 1,012 affected individuals (cases) and 1,362 controls followed by a replication study in an additional 3,624 cases and 12,197 controls of Chinese Han ethnicity, as well as 1,806 cases and 3,256 controls from Germany. We identified previously undescribed susceptibility loci at 5q22.1 (TMEM232 and SLC25A46, rs7701890, Pcombined = 3.15 × 10−9, odds ratio (OR) = 1.24) and 20q13.33 (TNFRSF6B and ZGPAT, rs6010620, Pcombined = 3.0 × 10−8, OR = 1.17) and replicated another previously reported locus at 1q21.3 (FLG, rs3126085, Pcombined = 5.90 × 10−12, OR = 0.82) in the Chinese sample. The 20q13.33 locus also showed evidence for association in the German sample (rs6010620, P = 2.87 × 10−5, OR = 1.25). Our study identifies new genetic susceptibility factors and suggests previously unidentified biological pathways in atopic dermatitis.

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