中科院两PI最新文章发表测序新成果

【字体: 时间:2011年09月14日 来源:生物通

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  近日来自中国科学院西双版纳热带植物园、中国科学院植物研究所和华大基因的研究人员能源植物小桐子胚的表达序列标签分析研究获新成果,相关研究论文在线发表在国际专业期刊《植物科学》(Plant Science)上。

  

生物通报道  近日来自中国科学院西双版纳热带植物园、中国科学院植物研究所和华大基因的研究人员能源植物小桐子胚的表达序列标签分析研究获新成果,相关研究论文在线发表在国际专业期刊《植物科学》(Plant Science)上。

中国科学院西双版纳热带植物园的徐增富研究员和中国科学院植物研究所的宋松泉研究员为这篇文章的共同通讯作者。该研究得到了中国科学院知识创新工程重要方向项目和云南省高端科技人才引进计划项目的资助。

小桐子(Jatropha curcas)又名小油桐、麻疯树、膏桐等,属于大戟科麻疯树属的多年生木本油料植物。种子含油率一般可达40%,能够在干旱、贫瘠的荒山和坡地种植,不与粮争地,目前被认为是最有希望的能源植物之一。然而,由于目前小桐子缺乏优良品种和高产栽培技术,种子产量较低,生产成本较高,严重制约了小桐子的产业化发展。因此,利用基因工程技术,对小桐子进行分子改良,与传统育种技术相结合培育优良品种对于小桐子产业化具有重要意义。

中国科学院西双版纳热带植物园热带植物资源开放实验室在职博士研究生陈茂盛等人在徐增富研究员和宋松泉研究员的指导下,与华大基因的王俊博士合作,对3个不同发育阶段的小桐子胚cDNA文库进行测序,共获得9844个高质量的表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列, 组装后得到4665个unigenes。经生物信息学分析,共找到59个unigenes可能参与小桐子的种子发育,61个unigenes参与脂肪代谢过程。研究人员已将这些小桐子胚EST序列提交到GenBank数据库 (accession numbers:FM887038-FM896881)上。

新研究获得了一些对小桐子种子发育和脂肪代谢起关键作用的基因,为小桐子的生长发育、脂肪代谢调控机制研究以及转基因分子育种等工作提供了非常重要的遗传信息资源。

(生物通:何嫱)

生物通推荐按原文摘要:

Analysis of expressed sequence tags from biodiesel plant Jatropha curcas embryos at different developmental stages

Jatropha curcas is considered a potential biodiesel feedstock plant whose seeds contain up to 40% oil. However, little is currently known about the seed biology of Jatropha. Therefore, it would be valuable to understand the mechanisms of development and lipid metabolism in Jatropha seeds. In the present study, three cDNA libraries were constructed with mRNA from Jatropha embryos at different stages of seed development. A total of 9844 expressed sequence tags (ESTs) were produced from these libraries, from which 1070 contigs and 3595 singletons were obtained. One hundred and seven unigenes were found to be differentially expressed in the three cDNA libraries of Jatropha embryos, indicating that these genes may play key roles in seed development. We have identified 59 and 61 unigenes that might be involved in the development and lipid metabolism in Jatropha seeds, respectively. Some of these genes may also play important roles in embryogenesis, morphogenesis, defense response and adaptive mechanisms in plants.
作者简介:

徐增富

能源植物分子育种研究组组长、研究员、博士生导师

学历:
1987年7月获南京农业大学农学系遗传育种专业学士学位。
1990年7月获南京农业大学农学系植物生理生化专业硕士学位 (导师:张荣铣教授)。
2001年4月获香港大学植物系植物分子生物学专业博士学位 (导师:Mee-Len Chye 教授)。
 
工作简历:
1. 1990年7月-1997年4月:中山大学生物工程研究中心李宝健教授实验室从事植物分子生物学和植物基因工程科研、教学工作,1992年10月聘为中山大学助理研究员。

2. 2001 年5月-2008年2月:中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室和有害生物控制与资源利用国家重点实验室从事植物分子生物学和植物基因工程科研、 教学工作。2001年6月晋升为中山大学基因工程教育部重点实验室副研究员。2004年4月晋升为中山大学生物化学与分子生物学教授、博士生导。2005 年6月被聘为国际学术期刊Plant Signaling & Behavior的编委。2005年12月入选教育部 “新世纪优秀人才支持计划”。2006年11月入选广东省高等学校“千百十工程”省级培养对象。

3. 2008年3月至今:中国科学院西双版纳热带植物园能源植物分子育种研究组组长、研究员、博士生导师, 热带植物资源开放实验室主任,能源植物科研团队负责人;中国科学技术大学兼职教授、博导。主要从事能源植物小桐 子(Jatropha curcas)的基因功能与基因工程研究工作。2008年6月入选中国科学院“能源植物分子育种”项目“****”。 2009年10月入选云南省高端科技人才引进计划。

作为项目负责人主持过包括国家高技术研究发展计划 (863计划)项目、国家自然科学基金项目和中国科学院知识创新工程重要方向项目等十多个科研课题的研究工作,已在中国科学, Plant Molecular Biology, Planta, Plant & Cell Physiology, Plant Physiology and Biochemistry, Analytical Biochemistry, Journal of Plant Growth Regulation等国内外专业期刊发表50多篇学术论文,其中33篇被SCI收录;申请国内外发明专利8项,已获授权发明专利5项。

宋松泉
中国科学院植物研究所研究员
 
2006.12- 中国科学院植物研究所,研究员
2004.12-2005.3 丹麦国家实验室, 高级访问学者.   
2002.3-2006.12 中国科学院西双版纳热带植物园, 研究员;
2002年8月入选中国科学院“****”,2006年6月通过终期评估.   
2002.5-2003.12 中山大学生命科学学院, 教授.   
1999.3-2000.3 南非纳塔尔大学 (University of Natal of South Africa) 生命和环境科学学院,博士后.   
1998.3-1999.3 瑞典隆德大学 (Lund University of Sweden) 植物生理学系,访问学者.   
1995.8-1996.8 香港大学 (University of Hong Kong) 植物学系,研究助理.   
1994.10-2002.5 中山大学生命科学学院,副教授.   
1992.7-1994.10 中山大学生命科学学院,讲师.   
1989.9-1992.7 中山大学生命科学学院,博士研究生.   
1982.2-1989.9 湖南师范大学生物系,助教,讲师   1978.3-1981.12 湖南师范大学生物系,本科   

行政职务:   
能源植物研发中心主任助理(2007年12月-)   

研究方向:   
能源植物种子活力的发育变化与蛋白质组的分析
种子顽拗性与植物种质资源的长期保存   
种子休眠与萌发的机理及其控制

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