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中国学者成果登Nature Genetics封面
【字体: 大 中 小 】 时间:2011年09月22日 来源:生物通
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九月Nature Genetics封面刊登了三项重要的研究成果,包括miRNAs与基因表达,精神分裂症易感基因,以及膀胱癌与染色质重塑。其中膀胱癌与染色质重塑相关成果由北京大学深圳医院和深圳华大基因主导完成。
(图片来自Nature Genetics杂志)
据报道,膀胱癌是目前世界上第九大癌症,每年约有15万人死于膀胱癌。膀胱移行细胞癌(TCC)是膀胱癌中最常见的组织学类型,男性发病率约为女性的3~4倍,多发生于40-70岁之间。膀胱癌在中国的发病率和死亡率均占泌尿系肿瘤的首位,目前,中国男性膀胱癌的年发病率已达十万分之八,并呈逐年上升的趋势。目前,国内外还未曾对膀胱移行细胞癌进行系统、全面的基因组学分析
在这篇文章中,研究人员对9例TCC患者样本进行了外显子测序研究,并在88例TCC患者样本中进行验证,发现54个与TCC发生相关的显著突变基因,其中49个基因是首次在膀胱癌中被发现。
染色质重塑(chromatin remodeling)是表观遗传修饰模式中的一种重要机制,其中的任何一个环节发生异常都会影响基因的正常表达,从而引起很多复杂的疾病。如果突变引起抑癌基因或调节细胞周期的蛋白出现异常,则可能会导致癌症的发生和发展,所以研究人员对膀胱移行细胞癌中染色质重塑相关基因进行了研究。
在测序结果中,研究人员发现了8个与染色质重塑相关的突变基因,除了UTX基因外,其他7个突变基因在原发性膀胱移行细胞癌中是首次被发现。在97例TCC患者样本中,有59%的患者的染色质重塑相关基因发生了体细胞突变,由此研究人员推测染色质重塑异常可能是导致TCC发生及发展的重要机制之一,这为目前难以医治的肿瘤提供了新的分子靶点。
文章的通讯作者包括华大基因的杨焕明院士,王俊研究员,以及北京大学深圳医院院长蔡志明教授。
(生物通:万纹)
原文摘要:
Frequent mutations of chromatin remodeling genes in transitional cell carcinoma of the bladder
Transitional cell carcinoma (TCC) is the most common type of bladder cancer. Here we sequenced the exomes of nine individuals with TCC and screened all the somatically mutated genes in a prevalence set of 88 additional individuals with TCC with different tumor stages and grades. In our study, we discovered a variety of genes previously unknown to be mutated in TCC. Notably, we identified genetic aberrations of the chromatin remodeling genes (UTX, MLL-MLL3, CREBBP-EP300, NCOR1, ARID1A and CHD6) in 59% of our 97 subjects with TCC. Of these genes, we showed UTX to be altered substantially more frequently in tumors of low stages and grades, highlighting its potential role in the classification and diagnosis of bladder cancer. Our results provide an overview of the genetic basis of TCC and suggest that aberration of chromatin regulation might be a hallmark of bladder cancer.
作者简介:
蔡志明
享受国务院和深圳市政府特殊津贴专家。泌尿外科主任医师,医学和管理学博士,博士生导师。现任深圳北京大学香港科技大学医学中心副主任兼北京大学深圳医院院长、泌尿外科研究所所长、男性生殖与遗传广东省重点实验室主任、深圳市医学会生殖医学专业委员会主任委员。从事医疗工作20多年。擅长外科学生殖医学专业,先后承担国家自然科学基金和国家985等研究项目12项,获医学和管理学科技成果11项。主编和参编专著7部,发表论文100余篇。2002年获“全国医院优秀院长”称号。
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