生物通报道：来自厦门大学生科院，中科院上海生化与细胞研究所，美国NIH等处的研究人员发表了题为“Recombinatorial Biases and Convergent Recombination Determine Interindividual TCRβ Sharing in Murine Thymocytes”的文章，通过深度测序技术，验证了TCR基因重组现象是不同个体间纯系型的主要决定因素，而不是选择性造成的。相关成果公布在J Immunol.杂志上。

文章的通讯作者分别为厦门大学生科院韩家淮教授，吉国力教授，以及美国NIH的David A. Price，第一作者为厦大李汉杰。这项研究得到973计划，国家自然科学基金等方面的资助。

TCR（T细胞抗原受体）属于免疫球蛋白超家族，为异二聚体，由α、β两条肽链组成，每条肽链又可分为可变区（V区），恒定区（C区），跨膜区和胞质区等几部分。

不同个体内T细胞受体(TCR repertoire )重叠提供了共用的T细胞响应的分子机制。在这篇文章中，研究人员通通过对三只不同小鼠个体CD4+CD8+ 胸腺细胞的深度排序，发现了TCRb 很大程度的重叠在T细胞发育的早起阶段已经出现，这些重叠由10-15%的遍布任意两个个体的全部独特氨基酸序列组成。

由于重组偏差（recombinatorial biases）的附带作用，大部分来自不同个体胸腺细胞受体中的共用TCRb有助于汇聚重组（convergent recombination）过程；在胸腺内部发育时的选择机制是微不足道的。

这些研究为不同个体内T细胞受体的重叠的机制提供了新的思路，同时验证了TCR基因重组现象的本质不同个体的纯系型，而不是选择性造成的。

（生物通；万纹）

原文摘要：

Recombinatorial Biases and Convergent Recombination Determine Interindividual TCRβ Sharing in Murine Thymocytes

Overlap of TCR repertoires among individuals provides the molecular basis for public T cell responses. By deep-sequencing the TCRβ repertoires of CD4+CD8+ thymocytes from three individual mice, we observed that a substantial degree of TCRβ overlap, comprising ∼10–15% of all unique amino acid sequences and ∼5–10% of all unique nucleotide sequences across any two individuals, is already present at this early stage of T cell development. The majority of TCRβ sharing between individual thymocyte repertoires could be attributed to the process of convergent recombination, with additional contributions likely arising from recombinatorial biases; the role of selection during intrathymic development was negligible. These results indicate that the process of TCR gene recombination is the major determinant of clonotype sharing between individuals.

作者简介：

 韩家淮教授在世界上率先发现p38信号通路。细胞内存在多条信号通路以介导不同的生物学反应。p38信号通路是细胞内最重要的信号通路之一，它在许多生物学反应包括细胞周期调控、细胞增殖、发育、分化、衰老、凋亡、免疫反应及肿瘤发生中起重要作用。韩家淮教授领导的实验室在p38信号通路的研究领域一直保持世界领先地位。韩家淮教授的研究重点是在先天性免疫系统中细胞内信号的传导。研究方向包括：1.炎症反应及免疫性疾病的分子机制；2.应激（如辐射、许多化学致癌物、病原体感染、炎症因子与基因突变等）反应与癌症发生以及其它疾病的关系。

迄今已在世界主流学术刊物上发表论文200余篇，其中9篇发表在Cell、Nature、Science上（6篇为通讯作者），14篇发表在Cell和Nature的姊妹杂志上（8篇为通讯作者）,并获美国专利多项。截止至2012年1月，论文被他人引用20000余次，单篇最高引用率2000余次。韩家淮教授的研究成果将会有助于进一步了解传染及免疫性疾病、心血管疾病和癌症发生的分子机理，从而为预防治疗这些人类顽疾提供一些新的思路和方法。

所获荣誉介绍：比利时Jean Stas奖 (1991)，美国心脏协会成熟研究员奖 (1995)，中国国家自然科学基金杰出青年奖(B类) (2001)，“卢嘉锡优秀导师奖” (2009)，“药明康德生命化学研究奖”一等奖 (2009)，“****成就奖” (2009)，自然科学研究一等奖 (2011)。

吉国力 教授、博导，系统工程研究所所长、现为厦门大学骨干教师、厦门市系统工程学会理事长，兼国家东部区域制造业信息化、国家863计划领域评审、国家科学技术奖励评审、国家重点新产品计划评估、福建省软科学及多个国际期刊评审的专家，也是the 2nd (2007) and 3rd (2008)、2010、2011)、2012、2013 annual conference on Bio-Inspired Computing:Theories and Applications大会PC组织者。

在研究项目课题内容方面，主要涉及：复杂系统的建模与仿真、生产调度优化、系统分析、决策支持、系统评估预测；过程控制与管理系统的动态集成、现代物流信息系统、计算机控制应用系统、MRPII/ERP/URP企业信息管理系统及辅助定制开发工具；数据挖掘技术、地理信息系统建模工具、网络环境下的信息综合与处理；先进控制的研究与应用、生物信息特征提取和位点识别以及原子限度的陶瓷材料仿真等多学科的国际合作研究。

打赏

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析！

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》