中国农大:玉米miRNA参与应答氮缺乏

【字体: 时间:2013年01月21日 来源:联川生物

编辑推荐:

  为了阐明玉米中氮传感与信号传导的分子生物学机制,中国农业大学李文学副教授领衔团队联合应用miRNA测序和降解组测序对玉米miRNA在氮缺乏条件下的调控作用展开了系统研究。该研究成果发表在近期的PLoS ONE上。

  

虽然最近研究表明,miRNA能调节植物对于营养缺乏的适应性应答,但对于miRNA在氮缺乏适应性应答的功能仍需进一步探索。为了阐明玉米中氮传感与信号传导的分子生物学机制,中国农业大学李文学副教授领衔团队联合应用miRNA测序和降解组测序对玉米miRNA在氮缺乏条件下的调控作用展开了系统研究*。该研究成果发表在近期的PLoS ONE上。

研究人员基于氮缺乏的玉米幼苗样本和对照样本构建了四个小RNA文库,并基于氮缺乏的玉米根样本构建降解组文库。通过深度测序技术(miRNA测序和降解组测序均由联川生物提供技术服务),发现了属于47个microRNA家族的共计99个全新的位点,和9个与已知miRNA:miR169,miR171, miR398同源的新位点。Northern blot分析证实8个miRNA家族(5个为保守的,3个为新发现的):miR169s,miR395s,miR528s,miR827s,miRC1,miR169w,miR171p/q,miRC19,以及miRC37在氮缺乏条件下出现显著的下调或上调。分析表明,预测和降解组测序鉴定的新发现miRNAs的靶基因与广泛的细胞应答与代谢过程密切相关。

玉米作为一种基础生物学研究的模式物种,此项研究成果也将促进理解miRNA在植物适应氮缺乏中的调控机制。

*Zhao M, Tai H, Sun S, Zhang F, Xu Y, Li WX. (2012) Cloning and characterization of maize miRNAs involved in responses to nitrogen deficiency. PLoS One 7(1), e29669. [article]

获取更多用户研究案例,请访问www.lc-bio.com或拨打免费咨询热线800-857-1452。

了解降解组测序服务的更多信息

关于联川生物
      
联川生物作为国内最早提供第二代测序技术服务的公司之一,拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组,可以为研究人员提供包括microRNA测序,数字基因表达谱测序,降解组测序,转录组测序等在内的全转录组水平的第二代测序技术服务。联川生物以您的研究需求出发,为您提供“从数据到科学发现”的个性化测序服务,全力加速您的研究工作。同时,也为您提供基于µParaflo®微流体定制化芯片平台的microRNA表达谱差异分析,提供可靠标准化的数据分析结果。我们是全球首家提供最新Sanger miRBase 19.0版(2012/08发布)microRNA表达谱芯片检测服务的公司。

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普

今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号