来自国家林业局、中科院上海生命科学研究院的研究人员成功地绘制出了速生非木材森林物种毛竹（moso bamboo）的基因组草图，从而为研究和遗传改良毛竹提供了一个宝贵的资源。相关成果发布在2月24日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。

国家林业局的江泽慧(Zehui Jiang)教授和中科院上海生命科学研究院植物生理生态所的韩斌（Bin Han）研究员共同领导了这一研究。

竹子是世界上最重要的非木材林产品之一。大约有25亿人在经济上依赖于竹子，每年竹子国际贸易总额超过25亿美元。竹子有着相当令人惊讶的生活史，在开花前其具有长达数十年的营养期，由此限制了遗传改良。毛竹是世界上最重要的一种竹类植物，开展毛竹全基因组测序及后基因组研究，对全面掌握禾本科植物基因组信息，了解竹类植物生物学特性的遗传学基础具有重要意义。

在这篇文章中，研究人员报告了一个2.05-Gb的高质量的毛竹基因组序列草图，覆盖达95%的基因组区域。将毛竹与其他草本植物，包括水稻、玉米、高粱进行比较基因组分析，获得了竹子与关系接近草类之间快速及显著表型和生态差异的新遗传学认识。

研究人员通过基因预测模型鉴别出毛竹31,987个基因，其中大多数获得了cDNA和深度RNA测序技术的支持。分析簇集基因家族和基因共线性表明，这种竹子在700-1200万年前经历了全基因组复制。鉴别对于细胞壁生物合成至关重要的基因家族，研究人员发现全基因组复制事件生成了与竹笋形成相关的更多基因重复（gene duplicates）。RNA测序分析毛竹开花组织表明，干旱胁迫和开花基因之间存在一种潜在的联系。

毛竹基因组测序是中国继参与完成人类基因组、水稻基因组计划后，第一个由我国科研人员自主发起的重大基因组计划。该项目的重大成果，将对毛竹和其他竹类植物的遗传改良、基础生物学研究和进化研究具有重要的推动作用。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

The draft genome of the fast-growing non-timber forest species moso bamboo (Phyllostachys heterocycla)

Bamboo represents the only major lineage of grasses that is native to forests and is one of the most important non-timber forest products in the world. However, no species in the Bambusoideae subfamily has been sequenced. Here, we report a high-quality draft genome sequence of moso bamboo (P. heterocycla var. pubescens). The 2.05-Gb assembly covers 95% of the genomic region. Gene prediction modeling identified 31,987 genes, most of which are supported by cDNA and deep RNA sequencing data. Analyses of clustered gene families and gene collinearity show that bamboo underwent whole-genome duplication 7–12 million years ago. Identification of gene families that are key in cell wall biosynthesis suggests that the whole-genome duplication event generated more gene duplicates involved in bamboo shoot development. RNA sequencing analysis of bamboo flowering tissues suggests a potential connection between drought-responsive and flowering genes.

作者简介：

江泽慧

女，1939年1月生，中共党员，中国林业科学研究院首席科学家，教授，博士生导师，木材科学与技术学科带头人。全国政协人口资源环境委员会副主任，中国科协常委，国家林业局党组成员，中国林业科学研究院院长，中国林学会理事长，国务院学位委员会委员，中国花卉协会会长，中国竹产业协会会长，国际竹藤组织（INBAR）董事会联合主席，国际竹藤网络中心董事会主席；国际木材科学院院士，加拿大Alberta大学名誉博士。

1992年，江泽慧获得享受国务院特殊津贴，1995年被国家教委授予“巾帼建功标兵”光荣称号，2002年6月，获全球环境领导奖。《Chinese Forestry Science and Technology》主编，同济大学、上海交通大学、扬州大学等兼职教授。

研究领域
江泽慧长期从事森林利用学、木材科学与技术以及生态学等学科领域的教学、科研和科技管理工作，先后主持和参加国家攀登计划项目、国家973项目、国家自然基金重点项目、国家863项目、GEF项目等重大项目，获国家、省部级科技进步奖12项。

韩斌

研究员、副所长。 1963年4月生，1992年在英国John Innes Centre, The Sainsbury Laboratory获博士学位； 1992-1998年，在英国剑桥大学植物科学系做博士后研究； 1998至今，中科院国家基因研究中心。自2001年2月起担任水稻基因组研究项目专家组组长和国家基因研究中心主任，负责水稻4号染色体的精确测序和籼、粳稻比较基因组学研究。国际水稻基因组测序计划(IRGSP)合作组核心成员。

研究方向：水稻功能基因组学研究；

研究内容：主要已水稻为模式植物和材料，开展植物功能基因组学和比较基因组学研究。

获奖情况：2003年3月获首届“中国科学院创新文化建设先进个人”光荣称号；2003年9月获中央组织部、人事部、中央宣传部、教育部、中央统战部和科学技术部授予的“留学回国人员成就奖”；2003年12月“水稻基因组第四号染色体测序及分析”项目获得上海市科学技术进步奖一等奖，排名第一；2004年4月被评为2001-2003年度上海市劳动模范。

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