中国科学家Nature子刊发布癌症突变景观图

【字体: 时间:2014年12月18日 来源:生物通

编辑推荐:

  来自第二军医大学、加拿大西蒙菲莎大学、复旦大学等处的研究人员,在新研究中绘制出了肝内胆管癌(intrahepatic cholangiocarcinoma)的突变景观图,研究结果发布在12月15日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

  

生物通报道   来自第二军医大学、加拿大西蒙菲莎大学、复旦大学等处的研究人员,在新研究中绘制出了肝内胆管癌(intrahepatic cholangiocarcinoma)的突变景观图,研究结果发布在12月15日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

第二军医大学上海东方肝胆外科医院的胡和平(Heping Hu)教授、复旦大学化学系的丁传凡(Chuanfan Ding)教授以及西蒙菲莎大学的Nansheng Chen教授是这篇论文的共同通讯作者。

肝内胆管癌(ICC)是仅次于肝细胞癌(HCC)的第二大肝脏常见恶性肿瘤(延伸阅读:Nature最新专题:聚焦肝癌 ),据报道其发病率约占肝癌的15%。其发病与华支睾吸虫、先天性胆管扩张症、孤立性肝囊肿、胆管错构瘤、肝内胆管结石、炎性肠病等因素有关。根据其组织学和细胞分化程度不同可分为乳头状腺癌、乳头状管状腺癌、腺鳞癌、鳞状细胞癌、黏液腺癌和不典型癌。肝内胆管癌的恶性程度极高,容易转移,非手术病人的中位生存期一般仅为9个月。相比较肝细胞癌而言,以往对肝内胆管癌发生与发展过程中的多基因变异特征缺乏系统的研究和了解。

在这篇文章中研究人员报道称,对103名中国肝内胆管癌患者的肿瘤和对照样本进行了测序,由此鉴别出了与肝炎、纤维化和肝硬化相关的、肝内胆管癌特异性的体细胞突变标记。随后他们进一步揭示出了25个具有显著意义的突变基因,包括8个潜在驱动基因TP53、KRAS, IDH1、PTEN、ARID1A、EPPK1、ECE2和FYN。

研究人员发现TP53缺陷的肝内胆管癌患者更有可能呈血清乙型肝炎病毒乙肝表面抗原(HBsAg)阳性,而在血清HBsAg阴性肝内胆管癌患者中几乎都发现有癌基因KRAS突变。他们证实在肝内胆管癌有3条信号通路(Ras/ PI3K信号通路、p53/细胞周期信号通路和TGF-β/Smad信号通路),一些对于表观遗传调控和氧化磷酸化至关重要的基因受到了显著影响。

新研究揭示出的这些突变对于设计进一步的研究,开发更好的诊断方法及有效疗法具有重要价值。

(生物通:何嫱)

作者简介:

胡和平,男,主任医师,教授,肝胆内一、二科副主任,博士生导师,专业技术五级,从医28年。亚太地区肝病学会委员,中华消化学会肝胆疾病专业组副组长,中国老年学会肿瘤专业委员会委员,全国重型肝病血液净化与人工肝协作组委员,解放军与上海市消化专业委员会委员,《中华消化杂志》,《胃肠病学》杂志编委等,获军队科技成果三等奖一项,擅长肝脏疾病诊断与处理。

丁传凡 ,男,1962年1月出生,安徽无为人,复旦大学教授,博士生导师,中国科学技术大学学士,硕士,复旦大学博士。自1990年起,先后任中国科学院化学研究所助理研究员和副研究员;日本东京大学访问学者;美国纽约州卫生部健康研究中心研究员;美国太平洋西北国家实验室和美国华盛顿州立大学博士后;加拿大维多利亚大学博士后和加拿大不列颠哥伦比亚大学化学系研究员。2003年11月应聘任复旦大学化学系教授。

主要研究:1.气相蛋白质分子的结构和性质;2.生物质谱新技术和新方法及其在蛋白质组学中的应用;3.分子和分子团簇的激光光电子能谱和物理化学性质。近年来在国内外学术刊物上发表三十余篇学术论文;申请并已转让美国专利三项,申请中国专利一项。

生物通推荐原文摘要:

Mutational landscape of intrahepatic cholangiocarcinoma

Intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) is a fatal primary liver cancer (PLC) that affects 5–10% of all PLCs. Here we sequence tumour and matching control sample pairs of a large cohort of 103 ICC patients in China, resulting in the identification of an ICC-specific somatic mutational signature that is associated with liver inflammation, fibrosis and cirrhosis. We further uncover 25 significantly mutated genes including eight potential driver genes (TP53, KRAS, IDH1, PTEN, ARID1A, EPPK1, ECE2 and FYN). We find that TP53-defective ICC patients are more likely to be HBsAg-seropositive, whereas mutations in the oncogene KRAS are nearly exclusively found in HBsAg-seronegative ICC patients. Three pathways (Ras/phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase signalling, p53/cell cycle signalling and transforming growth factor-β/Smad signalling), genes important for epigenetic regulation and oxidative phosphorylation are substantially affected in ICC. We reveal mutations in this study that may be valuable for designing further studies, better diagnosis and effective therapies.

 

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普

今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号