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Nature Biotechnology揭示Cas9改造极限
【字体: 大 中 小 】 时间:2016年05月04日 来源:生物通
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酿脓链球菌的Cas9现在已经被广泛用于基因组编辑。那么,对Cas9进行基因工程改造将面临哪些限制呢?加州大学伯克利分校的研究团队通过随机插入突变对Cas9结构进行了全面分析,鉴定了这种蛋白的基因改造热点。这些位点可以耐受PDZ结构域的插入,不影响Cas9的结合和剪切功能。
生物通报道:生物学家们一直在打磨能够进行DNA编辑的工具,而CRISPR技术很快成为了其中最耀眼的明星。CRISPR体系包括一个细菌核酸酶(Cas)和一段与目标DNA匹配的引导RNA,能为细菌沉默入侵者(比如病毒)遗传信息的关键部分。与其他基因编辑技术相比,CRISPR技术更易于操作扩展性也更强,因此迅速成为了科研领域的宠儿,为基因工程和生物医学领域带来了一场革命。
酿脓链球菌的Cas9现在已经被广泛用于基因组编辑。那么,对Cas9进行基因工程改造将面临哪些限制呢?加州大学伯克利分校的研究团队通过随机插入突变对Cas9结构进行了全面分析,鉴定了这种蛋白的基因改造热点。这些位点可以耐受PDZ结构域的插入,不影响Cas9的结合和剪切功能。这一重要成果发表在五月二日的Nature Biotechnology杂志上,文章通讯作者是加州大学伯克利分校的David F Savage,著名CRISPR先驱Jennifer A Doudna也参与了这项研究。
研究人员在自己鉴定的改造热点上插入雌激素受体α配体结合结构域,由此构建了别构调节的Cas9。研究显示,别构调节的Cas9在原核和真核细胞中表现出配体依赖的激活。这是一种能够诱导可逆Cas9活化的通用型单组分体系。这项研究为Cas9基因工程改造提供了宝贵信息,可以帮助人们快速生成新型Cas9用于基因组编辑。
加州大学伯克利分校以Jennifer A Doudna为首的研究团队取得了诸多令人侧目的CRISPR研究成果。去年十月,Doudna及其同事在Nature杂志上发表文章指出,Cas9 的HNH核酸酶结构域构象状态直接控制了DNA切割活性。他们通过分子内荧光共振能量转移(FRET)实验,鉴定了HNH核酸酶结构域的一种激活构象。研究还证实,一个α-螺旋将HNH的构象改变传达给RuvC结构域,激活它实现DNA切割。(更多详细信息请参见:Nature:揭示CRISPR/Cas9的DNA靶向切割机制)
今年年初,Doudna团队揭示了CRISPR-Cas9准备剪切DNA时的关键分子结构。在CRISPR-Cas系统中,Cas蛋白与小CRISPR RNA(crRNA)形成复合体,切割与RNA互补的外源DNA。R-loop是I型和 II型CRISPR-Cas的一个典型特征,基因组编辑常用的sgRNA就会和Cas9形成R-loop。为了阐明R-loop的作用,研究人员通过冷冻电镜获得了酿脓链球菌Cas9 R-loop的高分辨率结构。(更多详细信息请参见:CRISPR先驱Science再发重量级成果)
自CRIPSR系统被开发成研究工具以来,这一技术就陷入了激烈的知识产权之争。以Doudna为首的加州大学团队是CRIPSR专利的有力竞争者。前不久CRIPSR领域迎来了的一个重磅新闻,美国专利和商标局(USPTO)二月十六日将一项基因编辑专利授予了Doudna的Caribou Biosciences公司。这再次搅浑了原本已经相当复杂的CRISPR知识产权形势。(更多信息请参见:战况激烈,张锋对手获CRISPR新专利)
生物通编辑:叶予
生物通推荐原文:Profiling of engineering hotspots identifies an allosteric CRISPR-Cas9 switch