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Cell最新报道:CRISPR新发现
CRISPR分子开关
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年03月30日 来源:生物通
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CRISPR系统中,最赫赫有名的无疑当属CRISPR-Cas9。然而,共计19种不同类型的CRISPR Cas,每一种都可能具备独特的遗传工程优势。它们是一个庞大的未开发的基因组编辑工具。我们越了解这些系统的构造,越能更好的利用它们。
许多细菌都能对抗病毒感染。它们有一个RNA介导的“免疫系统”,叫做CRISPR Cas。利用CRISPR的天然属性(降解病毒RNA),科学家们几乎能去除任何生物中的任何基因。
CRISPR系统中,最赫赫有名的无疑当属CRISPR-Cas9。然而,共计19种不同类型的CRISPR Cas,每一种都可能具备独特的遗传工程优势。它们是一个庞大的未开发的基因组编辑工具。我们越了解这些系统的构造,便越能更好的利用它们。
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细菌CRISPR系统的核心部分是一个复杂的监控复合体,它能够识别病毒DNA然后捣毁它们。
但病毒也会反击。它们会利用一些anti-CRISPR蛋白使监控复合体丧失能力。
在此之前,没有人知道病毒的anti-CRISPR蛋白是如何工作的。来自Scripps 研究所(TSRI)的Gabriel C. Lander团队和蒙大拿州立大学的Blake Wiedenheft合作发表了一篇文章,第一次描述了anti-CRISPR蛋白的附着方式,揭示了它们攻占细菌防御系统的过程。
anti-CRISPR蛋白不仅能够锁定细菌识别、攻击病毒基因组的能力,甚至还玩起了模仿秀,欺骗CRISPR,使其脱靶!
这些微小的精密系统的相互作用,简直是一场进化军备竞赛,Lander说。
无声的战斗
研究人员通过低温电子显微镜(Eryo-EM)的高分辨率成像技术,发现了CRISPR和anti-CRISPR系统中一些不为人知的现象。
首先研究人员看到了CRISPR监控复合体分析病毒遗传物质弱点的方式。复合体内的蛋白质像手一样,紧紧抓住围绕在周围的CRISPR RNA,并暴露出一些特别的细菌RNA区域,这些区域负责扫描病毒DNA,快速寻找它们能够识别的基因序列。一旦CRISPR复合体鉴定出病毒DNA靶标,这个“监控机”立即开始招募其他负责捣毁病毒基因组的分子。
接下来研究人员开始分析病毒的anti-CRISPR蛋白质如何麻痹细菌监控复合体。他们发现,有一种类型的anti-CRISPR蛋白默默的附着在CRISPR RNA的暴露区域,以“身体”遮挡的方式阻止CRISPR系统对其扫描。
科学家们解释道,这些anti-CRISPR蛋白异常聪明。因为它们竟然找到了CRISPR监控系统中最关键的部分。如果强行阻止anti-CRISPR蛋白的附着,整个CRISPR系统甚至有可能“翻车”。 除非改变DNA识别机制,否则细菌的CRISPR系统将无法阻止病毒的“聪明”防御。
还有一种anti-CRISPR蛋白,对CRISPR使用了不同的计谋。通过分析它的位置和所带的负电荷,研究人员认为这种anti-CRISPR蛋白能够模仿DNA。愚弄CRISPR来与它们结合,吸引火力,解救病毒DNA。
一个完美的开关
研究人员相信,这些新的发现将提示我们构建更加复杂和高效的基因编辑工具。比如,在CRISPR系统中添加anti-CRISPR蛋白,以便随时阻断基因的降解。或者,通过调控anti-CRISPR蛋白的表达控制基因编辑的起始。
原文标题:Structure Reveals Mechanisms of Viral Suppressors that Intercept a CRISPR RNA-Guided Surveillance Complex
生物通报道
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