科学家分析了血液中循环的肿瘤DNA的短片段。这种液体活检分析利用了骨肿瘤独特的表观遗传学原理，并且不依赖于任何遗传改变，而这种改变在儿童期癌症中很少见。这种方法有望改善个性化诊断，并可能改善诸如尤因肉瘤等儿童肿瘤的未来治疗方法。

该研究已发表在Nature Communications杂志上。

由圣安娜儿童癌症研究所（St. Anna CCRI）的科学家与奥地利科学院CeMM分子医学研究中心合作进行的一项研究为儿童肿瘤的“液体活检”分析提供了一种创新方法。这种方法利用了肿瘤泄漏到血流中的小DNA片段的片段化模式，揭示了许多儿童期癌症的独特的表观遗传学特征。

包括尤文氏肉瘤在内的儿童和青少年骨肿瘤，临床上依然得不到充足的救治。Eleni Tomazou博士领导的研究小组展示了一种创新方法在肿瘤分类和监测中的效用，从而可以在不进行癌症治疗的情况下进行密切监视高浸润性肿瘤活检。

在肿瘤中，癌细胞不断分裂，其中一些癌细胞在此过程中死亡。这些细胞通常将其DNA释放到血流中，并在那里循环并可以使用基因组方法（例如高通量DNA测序）进行分析。这种所谓的液体活检分析为通常需要手术的常规肿瘤活检提供了微创的替代方法，为个性化治疗提供了广阔的前景。例如，可以经常检查肿瘤中的分子变化。然而，迄今为止，由于许多儿童肿瘤几乎没有从血浆中分离出的DNA中可检测到的遗传改变，因此液体活检用于儿童期癌症一直受到阻碍。

利用肿瘤特异性表观遗传模式

来自垂死的肿瘤细胞的无细胞DNA以小片段的形式在血液中循环。它们的大小既不是随机的，也不是仅由DNA序列决定的。相反，它反映了DNA如何包装在癌细胞内，并且受染色质（即DNA，蛋白质和RNA的复合物）的结构和这些细胞的表观遗传特性的影响。这是非常相关的，因为表观遗传模式（有时被称为基因组的“第二密码”）对于人体中不同的细胞类型在特征上是不同的。表观遗传机制导致基因功能的改变，这种改变不是基于DNA序列的改变，而是传递给子细胞。无细胞DNA片段化模式的分析为了解肿瘤内部的表观遗传学调控提供了独特的机会，而无需通过外科手术去除肿瘤细胞，甚至无需知道体内是否存在肿瘤以及在体内何处存在。

“我们以前鉴定了尤因肉瘤的独特表观遗传学特征。我们认为这些特征性表观遗传学特征应保留在血液中循环的肿瘤衍生DNA的片段中。这将为我们提供急需的早期诊断和肿瘤标志物使用液体活检概念进行分类”，首席研究员Tomazou博士解释说。

（生物通：万纹）

原文链接：

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-23445-w