新泽西州罗格斯癌症研究所是该州领先的癌症中心，也是唯一的国家癌症研究所指定的综合癌症中心，来自该研究所和RWJBarnabas Health的研究人员对胰腺肿瘤的微生物组进行了检查，并在单细胞分辨率中确定了与炎症和低生存率相关的特定微生物。根据研究人员的说法，这些微生物可能是胰腺癌早期诊断或治疗的新目标，胰腺癌是美国男性和女性癌症死亡的第四大原因。研究结果发表在《癌症细胞》(Cancer Cell)的在线版。

微生物是肉眼看不见的微小生物。生活在我们体内的微生物比人体细胞的总数还要多，可以在胰腺等器官中找到，而胰腺一度被认为是没有微生物的。Rutgers癌症研究所的首席研究员Subhajyoti De博士和Rutgers Robert Wood Johnson医学院医学博士项目的研究生Bassel Ghaddar一起开始探索胰腺肿瘤中是否存在微生物，以及它们对癌症进展或治疗是否有影响。然而，研究肿瘤中的微生物是困难的，部分原因是每个患者都是不同的，而且微生物足迹太细微了，无法可靠地检测。

为了进一步探索，研究人员与医学博士Martin Blaser合作，他是世界著名的微生物组专家。研究人员开发了一种称为SAHMI(宿主-微生物组相互作用的单细胞分析)的基因组方法来识别与单个人类细胞相关的微生物。通过使用复杂的软件筛选数百万个RNA序列，他们确定了哪些可能代表人类基因，哪些来自微生物。“这项新技术使我们能够识别与肿瘤相关的微生物，同时测量宿主细胞的活性，这是一个重大的技术进步，结果令人震惊，”De博士说，他也是罗格斯大学罗伯特伍德约翰逊医学院癌症系统生物学副教授。

研究小组对两组独立的胰腺肿瘤进行了研究，发现其中一些肿瘤中含有与特定细胞类型相关的细菌，而这些细菌在正常胰腺组织中基本不存在。这些细菌主要位于肿瘤细胞内，它们的数量与癌症相关的细胞活性相关。发现的微生物的特定特征预示着癌症的恶化和不良预后。

胰腺肿瘤内的微生物足迹提出了一个问题，即存在的免疫细胞是对癌症还是对微生物作出反应。研究结果表明，免疫反应主要是针对肿瘤中的微生物，而不是癌细胞。“我们的观察为为什么胰腺癌如此难以治疗提供了一个新的观点，”Blaser博士说。“但更好地理解这些相互作用可能会找到新的治疗方法。”

Tumor microbiome links cellular programs and immunity in pancreatic cancer