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研究揭示复发儿童AML的高危亚型
【字体: 大 中 小 】 时间:2022年02月21日 来源:Blood Cancer Discovery
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圣裘德儿童研究医院(St. Jude Children 's Research Hospital)的科学家们在一种儿童白血病亚型中发现了一种以前被忽视的突变,它对识别高危患者有一定意义。
当急性髓细胞白血病(AML)复发时,治疗更加困难,结果令人沮丧。圣裘德儿童研究医院(St. Jude Children 's Research Hospital)的科学家们发现了儿童急性髓细胞白血病(AML)的一种突变,医生可以利用这种突变来识别高风险患者,并更好地指导治疗。今天,一篇关于这项工作的论文发表在美国癌症研究协会的《血癌发现》杂志上。
“我们开始的范围很广,因为很明显,我们对儿童急性髓细胞白血病复发的原因一开始就没有足够深入的了解,”St. Jude病学系联合通讯作者Jeffery Klco医学博士说。“我们在St. Jude有很多针对复发AML的临床试验,这让我们获得了大量的样本,这也是我们与计算生物学同事的合作在帮助我们分析遗传学方面变得非常有益的地方。
Klco说:“很早就清楚,有一组病例在这种基因UBTF中有奇怪的改变,这在过去真的只是表面上被考虑过。”
一种新的高危子类型
研究人员对136名St. Jude复发AML患者的基因组学进行了评估。一种被称为UBTF外显子13串联重复(UBTF- td)的特殊突变类型在9%的复发儿童AML中发生。这表示以前未识别的重要子类型。
UBTF-TD AML在儿童比成人更常见。它还与不良结果和微小残留病(MRD)的发生率增加有关。MRD指的是在最初的治疗后,癌细胞数量持续减少,经常导致癌症复发。
基因分析
AML的基因组学已经被研究了很多年,但这种突变在以前的工作中大多被忽视或未被发现。圣犹大大学的研究人员开发了计算方法,在AML和其他癌症中识别这种突变,以及潜在的类似突变。
“这是一种极其难以检测的突变,所以人们花了大量的工作来开发正确的算法。我们必须从零开始开发我们的方法,”联合通讯作者、圣裘德计算生物学系的马小图博士说。“现有的大多数方法都假设只有一个事件会产生这些突变,但就像ubf - td一样,情况并非总是如此。”
“现在我们知道我们在寻找什么以及如何找到它,我们可以很容易地将其应用到临床基因组学中,”马说。
临床基因组学可以用来筛选AML中的UBTF-TD突变,以帮助识别高危患者。这个过程已经在圣犹大进行了。这些发现也开辟了新的研究领域,包括发现以UBTF-TD产生的蛋白质为靶点的方法,以及确定异常肽如何导致白血病。