这些发现可能有助于解释一些基于社区的预防研究的结果，并帮助科学家找到更好的方法来跟踪和预防艾滋病毒的传播。

早期发现和治疗艾滋病毒有助于防止病毒传播。然而，在撒哈拉以南非洲开展的以社区为基础的普遍艾滋病毒检测和治疗的大规模研究，并没有像数学模型预测的那样有效地遏制新感染。

“为了遏制新的艾滋病毒感染的蔓延，我们需要更好地了解该地区的艾滋病毒传播模式，”第一作者、美国波士顿哈佛大学陈教授公共卫生学院传染病动力学中心博士后研究员Lerato Magosi说。

马戈西和他的同事着手研究非洲博茨瓦纳的艾滋病传播模式。该团队对从30个社区的5114人收集的艾滋病病毒样本进行了基因测序，这些人参加了一项艾滋病预防试验。这项名为博茨瓦纳联合预防项目(简称Ya Tsie)的试验将随机接受艾滋病毒普遍检测和治疗的社区与没有接受这种干预的社区的艾滋病毒传播进行了比较。

通过识别基因上密切相关的艾滋病毒样本，该团队能够追踪病毒如何在这些社区内部和之间传播。他们发现，大多数艾滋病毒传播发生在年龄相仿的个体之间，以及生活在同一社区或邻近社区的个体之间，而不是遥远的社区。病毒从没有接受普遍艾滋病毒检测和治疗干预的社区传播到接受干预的社区的可能性更大，反之亦然。

Magosi解释说:“我们的研究结果表明，基于社区的艾滋病毒检测和治疗举措是减少艾滋病毒传播的有力工具，但还需要有针对性的研究支持，以弥合接受检测和治疗方面的年龄和性别差距。”

这组作者建议，基因测序可能是帮助确定艾滋病毒传播地域模式的一种有价值的工具。他们还建议在可能混杂的社区广泛分发艾滋病毒检测和治疗干预措施。“人口流动模式是理解艾滋病毒传播动态的核心，在设计和测试艾滋病毒控制策略时应加以考虑，”该研究的资深作者、流行病学教授兼传染性疾病动态中心主任Marc Lipsitch总结道。

Journal Reference:

1. Lerato E Magosi, Yinfeng Zhang, Tanya Golubchik, Victor DeGruttola, Eric Tchetgen Tchetgen, Vladimir Novitsky, Janet Moore, Pam Bachanas, Tebogo Segolodi, Refeletswe Lebelonyane, Molly Pretorius Holme, Sikhulile Moyo, Joseph Makhema, Shahin Lockman, Christophe Fraser, Myron Max Essex, Marc Lipsitch. Deep-sequence phylogenetics to quantify patterns of HIV transmission in the context of a universal testing and treatment trial – BCPP/Ya Tsie trial. eLife, 2022; 11 DOI: 10.7554/eLife.72657