期待已久!MERFISH超分辨率空间转录组学技术服务终于来了!

【字体: 时间:2022年09月20日 来源:

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  基因集团上海贝晶生物技术有限公司国内首家推出MERFISH超分辨率空间转录组学技术服务,欢迎感兴趣的研究者咨询和合作!

  

超分辨率•亚细胞水平•高灵敏度

基因集团上海贝晶生物技术有限公司国内首家推出MERFISH超分辨率空间转录组学技术服务,欢迎感兴趣的研究者咨询和合作!

MERFISH:多重荧光原位杂交
(Multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization)

RNA在细胞中的分布对其表达有很重要的调节作用,因此研究RNA的空间位置有很重要的意义。单分子荧光原位杂交技术(single-molecule FISH,smFISH)是进行原位基因表达检测的金标准,但其检测通量较低。

华人科学家美国工程院院士庄小威(哈佛大学)发明了MERFISH(Multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization)多重荧光原位杂交技术,突破了传统的smFISH的技术通量低的缺陷,可以在单细胞中同时检测多至500种基因甚至更多。

首家引进
MERSCOPE™超分辨率成像分析系统

2021年,美国Vizgen公司发布了世界上第一款商品化的MERFISH超分辨率成像分析系统MERSCOPE™。2022年基因集团首家引进该平台,落地上海贝晶生物技术有限公司紫竹高新技术开发区实验室。

基于核心MERFISH技术,MERSCOPE™可对1cm²的组织进行超分辨成像,分辨率≤100纳米,定位单细胞中RNA的空间分布以及定量基因表达。实现真正意义上的原位单细胞空间基因组分析,让基因的表达和定位可视化,推动基因组学的研究步入下一代!

MERFISH空间转录组技术的优势

1. 空间分辨率高:≤100nm分辨率,在亚细胞水平上定位RNA转录本
2. 灵敏度高:无需测序,能检测到其它方法检测不到的低表达基因
3. 高度多重:客户自定义gene panel设计,目前最多500个基因,后续会升级到1000 gene panel
4. 多样本适用性:目前适用于新鲜的/固定冰冻的超薄组织切片、细胞涂片等,短期内会实现FFPE样本方案
5. 多种应用:涉及肿瘤学、免疫学、神经生物学、感染性疾病、发育生物学&再生医学、药物开发、细胞和基因治疗等多个研究领域。


交互式软件&可视化数据

可视化MERFISH数据的交互式软件MERSCOPE Vizualizer™,可产生包括细胞分区分析、检测到的转录本和高分辨率图像,所得数据兼容第三方软件分析。

专业的数据分析团队可为您提供标注特定基因的细胞群体聚类结果。


MERFISH技术文章举例

Stogsdill, Jeffrey A et al. “Pyramidal neuron subtype diversity governs microglia states in the neocortex.” Nature vol. 608,7924 (2022): 750-756. doi:10.1038/s41586-022-05056-7
Fang, Rongxin et al. “Conservation and divergence of cortical cell organization in human and mouse revealed by MERFISH.” Science (New York, N.Y.) vol. 377,6601 (2022): 56-62. doi:10.1126/science.abm1741
De Luca, Roberto et al. “Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal.” Nature communications vol. 13,1 4163. 18 Jul. 2022, doi:10.1038/s41467-022-31591-y
Zhang, Meng et al. “Spatially resolved cell atlas of the mouse primary motor cortex by MERFISH.” Nature vol. 598,7879 (2021): 137-143. doi:10.1038/s41586-021-03705-x
Favuzzi, Emilia et al. “GABA-receptive microglia selectively sculpt developing inhibitory circuits.” Cell vol. 184,15 (2021): 4048-4063.e32. doi:10.1016/j.cell.2021.06.018
Lu, Yanfang et al. “Spatial transcriptome profiling by MERFISH reveals fetal liver hematopoietic stem cell niche architecture.” Cell discovery vol. 7,1 47. 29 Jun. 2021, doi:10.1038/s41421-021-00266-1
......

联系我们

基因集团上海贝晶生物技术有限公司全国首家推出MERSCOPE™ MERFISH空间基因组学技术服务。

基因集团基因有限公司为美国Vizgen公司MERSCOPE™多重FISH超分辨率成像分析系统中国总代理。

如果您感兴趣,可以直接联系您身边的基因人。


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