牛津大学出版社发表在《Molecular Biology and Evolution》杂志上的一篇新论文首次为穿山甲(有时被称为有鳞食蚁兽)提供了一套全面的基因组资源，研究人员认为这将是保护这些受威胁的哺乳动物不可或缺的一部分。

穿山甲生活在亚洲和撒哈拉以南的非洲，是唯一一种全身有鳞片的哺乳动物。为了获取它们的肉和所谓的药用价值，它们被以创纪录的数量贩卖。由于它们的栖息地被广泛砍伐，这些动物也处于危险之中。穿山甲由八个幸存的物种组成，近年来引起了公众的极大兴趣和保护工作。这主要是因为它们是地球上被贩运最多的野生哺乳动物，而且最近有(不正确的)说法认为它们可能与COVID-19大流行有关。

尽管保护环境恶劣，但对穿山甲的研究不足，在基本物种或种群研究方面仍存在重大差距。研究人员现在越来越关注野生动物研究中的基因组学，因为它为物种或种群划分、人口统计信息、多样性、历史轨迹和动物对全球变化的适应能力提供了更准确的信息。更不用说它在追踪非法交易个体的来源、更好地确定偷猎热点和破坏贩运网络方面的潜力了。

穿山甲基因组研究的挑战

获得关于穿山甲的全基因组信息是一项具有挑战性的任务。首先，穿山甲物种之间的地理隔离和有限的化石记录构成了方法上的障碍。亚洲和非洲穿山甲物种大约在3790万年前分化，这使得在使用遥远物种的参考基因组时很难真正理解这一群体的进化。其次，这种动物难以捉摸的行为和热带分布使得基因取样既昂贵又耗时。

研究结果及影响

这里的研究人员对原产于非洲的巨型穿山甲的第一个参考基因组进行了测序、组装和注释，并对黑腹穿山甲、特明克穿山甲、印度穿山甲和菲律宾穿山甲的基因组进行了测序和组装。这些新的基因组数据，连同先前公布的关于其余三种穿山甲(白腹穿山甲、巽他穿山甲和中国穿山甲)的信息，提供了第一套完整的穿山甲基因组。在此过程中，研究人员还从先前发布的基因组数据中发现了一种潜在的新穿山甲物种。

研究人员认为，这些信息最终将提供关于穿山甲如何随着时间的推移而进化以应对不断变化的环境条件的完整信息，将为如何通过未来几年的保护优先事项和管理计划有效地保护动物提供关键信息。产出也将有助于开发用于追踪穿山甲贸易的DNA工具包。

该论文的作者之一Sean Heighton说:“这项研究的合作方式来自非洲、亚洲和欧洲的作者，这让我们第一次用全基因组的视角深入研究了穿山甲在所有8个物种中的进化。我们希望这些基因组将成为进一步基因研究的基础，这将有助于保护这些动物。”

参考文献:

“Pangolin Genomes Offer Key Insights and Resources for the World’s Most Trafficked Wild Mammals” by Sean P Heighton, Rémi Allio, Jér?me Murienne, Jordi Salmona, Hao Meng, Céline Scornavacca, Armanda D S Bastos, Flobert Njiokou, Darren W Pietersen, Marie-Ka Tilak, Shu-Jin Luo, Frédéric Delsuc and Philippe Gaubert, 5 October 2023, Molecular Biology and Evolution.