Science:“MIDAS”平台—蛋白质与代谢物的相互作用检测新技术

【字体: 时间:2023年03月13日 来源:AAAS

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  为了帮助改善蛋白质和代谢物之间难以捉摸的相互作用的发现和表征,研究人员提出了MIDAS新方法。作者表示,MIDAS代表了一种强大的新工具,可以“识别、理解和利用以前未知的蛋白质-代谢物相互作用组的代谢调节模式”。

  

蛋白质和代谢物之间的相互作用难以捉摸,要想找到其表征,并不是一件容易的事情,在最新一项研究中,研究人员提出了MIDAS方法,即Mass spectrometry Integrated with equilibrium Dialysis for the discovery of Allostery Systematically(质谱集成平衡透析系统地发现变构)。

作者表示,MIDAS代表了一种强大的新工具,可以“识别、理解和利用以前未知的蛋白质-代谢物相互作用组的代谢调节模式”。

蛋白质和小分子代谢物之间的相互作用是最常见和最基本的生物相互作用类型之一,在调节蛋白质功能和控制各种细胞过程中起着至关重要的作用。然而,蛋白质-代谢物相互作用(PMIs)的发现和表征一直是零星的和具有挑战性的。

为了解决这个问题,Kevin Hicks和同事开发了MIDAS平台,该平台能够系统地发现难以捉摸的PMI。使用MIDAS, Hicks等人分析了来自人类碳水化合物代谢的33种酶和401种代谢物的相互作用,揭示了830种PMIs。

MIDAS确定了PMI与以前已知的调节剂、底物和产品的关系,但该方法也使作者从不同的代谢途径中发现了许多以前未知的PMIs,包括ATP和长链酰基辅酶a对乳酸脱氢酶的调节。这一发现可能是不同组织中脂肪和碳水化合物代谢之间意想不到的生理关系的一种机制,并可用于治疗癌症的有氧糖酵解。

文章标题

Protein-metabolite interactomics of carbohydrate metabolism reveals regulation of lactate dehydrogenase

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