提到真菌，大多数人可能会想到他们在秋天采摘的蘑菇，或者是他们在烘焙或酿酒时添加的酵母。其他人可能会想起上周发霉的面包，或者在冰箱里变坏的黄瓜。事实上，几个世纪以来，真菌学家一直将这些真菌作为食物和发酵的来源，同时也将其作为腐烂和疾病的来源。

但是，虽然我们习惯于将真菌视为形成子实体等物理结构的生物体，或者我们可以在厨房或实验室中生长的类似酵母的生命形式，但逐渐变得清晰的是，真菌并不仅仅属于这两类。对土壤等环境基质的DNA测序研究发现了大量证据，表明大量真菌似乎不能形成子实体，我们似乎无法在实验室中生长——但它们仍然存在。这些群体通常被称为“暗真菌”，这与天文学中的“暗物质”概念类似——我们知道暗物质就在那里，但我们现在无法直接观测到。

《MycoKeys》杂志上的一项新研究对比了使用传统真菌学方法和使用环境DNA测序方法恢复的真菌物种的积累。即使考虑到各种各样的偏差，作者发现，在过去五年中，通过环境测序发现的物种数量大大超过了传统的物种恢复速度，并呈现出强劲的增长趋势。作者得出结论，黑色真菌形成了真菌王国的一个决定性特征。

“这就是有趣的地方，”瑞典哥德堡大学的亨里克·尼尔森(Henrik Nilsson)说，他是这项研究的主要作者。“根据目前的命名规则，这些真菌不能被赋予科学名称——它们不能被正式描述。至于那些无法正式命名的物种和群体，它们往往会落在缝隙之间。它们通常不会被考虑到自然保护计划中。在估算真菌的进化史时，它们经常被忽略，当我们试图弄清楚生态系统中的质量和能量是如何流动的时，它们的生态作用和联系在很大程度上被忽视了。他们基本上被当作不存在的人对待。”

瑞典乌普萨拉大学的第二作者马丁·里伯格插话说:“这并不像我们在一个几乎完整的拼图游戏中添加了几个缺失的碎片。似乎正好相反。我们说的是几十大类真菌，成千上万种，其中一些似乎非常常见，以至于我们还没有找到一个土壤样本中没有它们。事实上，我们谈论的可能是真菌王国的主导生活方式。”

真菌学界一直在争论是否应该修改真菌命名规则，以允许对这些黑色真菌进行正式描述。到目前为止，这个问题还没有得到肯定的解决。尼尔森说:“我认为我们的研究表明，是时候立即停止这种争论了。”“我们应该讨论的是我们应该如何描述它们。一种黑色真菌要获得正式的科学名称必须满足哪些标准?显然，子实体的形成或在实验室中的生长不能成为这些标准的一部分。”

奥地利维也纳大学的合著者Alice Retter解释说:“我们认为我们应该通过列出我们认为有意义的标准来启动关于如何进行的辩论——这些标准足够严格，只允许对特别经过严格审查的黑真菌进行描述，在这个过程中保持高度的科学严谨性和可重复性。我们将自己的观察结果与真菌学界的建议结合起来，这些建议是从bioRxiv的手稿预印本中挑选出来的。我们当然不会声称我们的建议是这场辩论的最终结果。更像是第一批。我们认为真菌学界将能够共同提出一套关于这个问题的合理指导原则——这里有一组对成核的初步善意观察。”

作者主张对支配真菌命名的命名规则进行温和的修改，至少允许对记录最充分的暗真菌物种和群体给予正式的名称。目前，建议的修改将排除许多罕见的或其他没有充分记录的黑色真菌的正式描述。

爱沙尼亚塔尔图自然历史博物馆的资深作者Kessy Abarenkov断言:“但你不需要对所有事情都有理论，才能对某些事情有理论。”“通过建立描述深色真菌所需的规则，并指定我们目前必须避免描述此类物种的时间，真菌学家可以做他们最擅长的事情:坚持不懈地收集足够的研究数据，以保证对深色真菌进行命名，一个组一个组，一个物种一个物种。这是真菌学几百年来的强项。只是设定有点新。”

塔尔图大学(University of Tartu)的Sten Anslan继续说道:“显然，很多事情都处于危险之中。目前管理真菌命名的规则很长一段时间以来都很适用于真菌学。我们不想颠覆或推翻他们。但我们担心，如果在这方面不进行更新，它们就有可能随着时间的推移而变得越来越过时。从长远来看，一本规则书可能只统治它最初设想要统治的极少数生物——真菌王国——似乎是站不住脚的。”

瑞典农业大学的Marisol Sanchez-Garcia总结道:“明年在荷兰马斯特里赫特举行的国际真菌学大会上，黑色真菌的命名方面可能会被详细讨论。我们希望真菌学界能够就将这种黑色真菌纳入命名规则达成有意义的协议。毕竟，真菌学家习惯于在日常的基础上协商和解决一些重要的问题，这个问题也几乎没有什么不同。作为研究一个巨大的，或多或少未知的生物群体的一部分，其中很少有珍贵的东西是一成不变的，而且规则必须随着时间的推移而调整，以努力跟上最近的发展，嗯，这就是在我看来，成为一名真菌学家如此有趣和有益的原因。”