表观遗传最新突破:构建胚胎m6A图谱,了解关键RNA修饰

【字体: 时间:2023年04月25日 来源:AAAS

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  一项新的研究成功构建了小鼠胚胎中m6A的图谱,这是绘制m6A修饰图谱的最新前沿之一。

  

RNA,特别是mRNA,最近作为COVID-19疫苗的主要成分受到了一些宣传。

它在生物体中的典型工作是将细胞核内DNA编码的遗传物质带入细胞内部,在那里它被转化为蛋白质,在体内执行不同的功能。然而,在这发生之前,RNA被修饰以使其更稳定和成熟。

动物细胞中最常见和最重要的RNA修饰之一被称为n6 -甲基腺苷,或m6A。在过去的十年里,科学家们已经揭示了m6A的修饰具有多种功能,从细胞的编程到胚胎的发育。

计算医学领域研究人员的一个主要目标是描述转录组——细胞中所有RNA读数的总和——包括像m6A这样的修饰。有了这个读数,科学家就能知道细胞中基因的开启和关闭时间,这在很大程度上决定了细胞的最终命运。

密歇根大学医学院计算医学和生物信息系Kin Fai Au博士的研究成功构建了小鼠胚胎中m6A的图谱,这是绘制m6A修饰图谱的最后前沿之一。

Au说:“由于早期胚胎发育中的细胞物质数量有限,因此绘制m6A修饰图谱非常具有挑战性。”例如,所研究的RNA的数量以皮克为单位,即1克的万亿分之一。

他的团队与挪威奥斯陆大学的合作者阿恩·克伦格兰博士和约翰·阿恩·达尔博士一起,通过收集六个发育阶段的小鼠胚胎,为每个阶段生成转录组范围内的m6A图谱,完成了他们的研究。

在此过程中,他们发现了从母体遗传的基因与从发育中的胚胎激活的基因的m6A修饰的有趣模式。他们还发现m6A分布在所谓的转座因子中,在发育中的胚胎中,这些转座因子以前被认为是“垃圾”,因为它们不编码蛋白质。

Au说,这项研究填补了转录组学领域的空白,并使研究人员能够进一步研究m6A在发育过程中的功能。“现在我们对早期胚胎发育中不同层次的组学有了更全面的了解。”

原文标题:

“The RNA m6A landscape in mouse oocytes and preimplantation embryos,” Nature Structural & Molecular BiologyDOI: 10.1038/s41594-023-00969-x

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