研究人员发现了与成瘾相关的大脑区域的关键基因表达差异

【字体: 时间:2024年10月16日 来源:news-medical

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  研究人员发现了与成瘾相关的大脑区域的关键基因表达差异,为酒精使用障碍和潜在的治疗目标提供了新的见解。

  

              

新的研究揭示了与成瘾有关的大脑区域的基因表达差异,强调了创新酒精使用障碍治疗和药物再利用机会的途径。

该研究揭示了伏隔核(NAc)和背外侧前额叶皮层(DLPFC)中几种新的差异表达基因(DEGs),其中许多基因之前并未与酒精使用障碍(AUD)相关,从而扩大了对成瘾的遗传理解。

最近发表在《分子精神病学》杂志上的一项研究通过对两个与成瘾相关的大脑区域,即伏隔核(NAc)和背外侧前额叶皮层(DLPFC)的基因表达模式进行meta分析,为AUD提供了神经生物学的见解。

通过对多个独立数据集进行荟萃分析,该研究确定了与AUD相关的差异表达基因(DEGs),由于增加了统计能力和大样本量,该研究提供了可靠的发现。

荟萃分析显示,共有476个deg, NAc和PFC之间有25个重叠,突出了与AUD相关的共享和区域特异性基因表达模式。

AUD的患病率及其神经学意义

酗酒每年造成数百万人死亡。尽管多项基于基因组的研究表明了AUD的遗传性,但与这种疾病相关的基因调控景观仍不清楚。了解神经生物学机制有助于确定潜在的目标,以制定有效的干预措施来缓解AUD。

作为多巴胺能中边缘系统的组成部分,大脑的NAc、前额叶皮层(PFC)和DLPFC区域与奖励通路和成瘾有关。这些大脑区域与成瘾密切相关;例如,NAc与暴食/醉酒阶段有关,DLPFC与专注/期待阶段有关。

PFC调节多巴胺释放到NAc。多项研究表明,PFC损伤会对执行功能和冲动性产生负面影响,并增加风险行为的参与。总的来说,NAc和PFC脑区与AUD高度相连。

有限数量的研究探索了aud在人脑中相关的大量RNA-seq基因表达。本研究对独立数据集的荟萃分析显著增强了研究结果的可靠性。这些研究能够鉴定AUD患者大脑中的差异基因表达(DGE)。

关于研究

死后人类NAc和DLPFC样本来自122名候选人,即61名AUD和61名非AUD,作为Lieber脑发育研究所(LIBD)人脑库的一部分。

根据精神障碍诊断与统计手册第5版(DSM-5)症状确定AUD病例和对照组。AUD病例是指在12个月内出现两种以上症状的患者,而非AUD对照组是指没有DSM-5 AUD症状的终生病史的患者。此外,非aud病例显示死后乙醇毒理学低于0.06 g/dL。

关注脑特异性基因调控:研究强调在NAc和DLPFC中发现的deg与大脑其他区域(如腹侧纹状体(VS)和尾状核(CN))的AUD没有显著相关性,提示AUD存在区域特异性基因调控。

AUD病例和对照组与重度抑郁症(MDD)和吸烟状况相匹配。必须指出的是,重度抑郁症和吸烟是AUD最常见的两种合并症。

从AUD和非AUD组织中提取RNA,使用Illumina TruSeq Total RNA strand RiboZero Gold进行文库制备。这些样本被称为NAc_LIBD和PFC_LIBD数据集。从UT Austin和NYGC获得的其他样品分别称为NAc_UT, PFC_UT和PFC_NYGC。

使用各种生物信息学工具(包括Trimmomatic和GENCODE v40 (GRCh38)转录组)处理来自不同来源的所有RNA-seq数据,并计算质量控制(QC)指标。估计PFC和NAc中不同细胞类型的比例,如小胶质细胞、巨噬细胞、兴奋性神经元、少突胶质细胞前体细胞(OPCs)、gaba能神经元、少突胶质细胞、t细胞、星形胶质细胞和中棘神经元(MSNs)。

通过线性回归分析,建立基于吸烟、年龄、性别和重度抑郁症的细胞类型比例与AUD状态之间的关系。生物信息学工具还用于确定与AUD病例相关的DGE,并了解基因共表达。值得注意的是,使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)的基因共表达分析揭示了NAc和PFC之间共享的和区域特异性的基因网络,进一步深化了对aud相关分子机制的认识。

研究结果

在NAc_LIBD和PFC_LIBD数据集中,分别鉴定出90个和98个差异表达基因(deg)。在两个数据集中发现了12个基因重叠。在NAc_UT数据集中测试的20,958个基因中没有鉴定出deg。在PFC_UT和PFC_NYGC数据集中,分别识别出14和53度。这些新发现的与AUD相关的deg为AUD在特定大脑区域的基因表达特征提供了见解。

在PFC中共鉴定出447个与AUD相关的deg。然而,在NAc和PFC中发现了25个与AUD相关的基因差异表达。在NAc样本中重叠基因的meta分析中发现的前5个DEG基因是ODC1、ZNF844、ARRDC3、FAM225A和GUSBP11,在PFC样本中发现的是TXNIP、ODC1、HMGN2、SLC16A9和SLC16A6。

目前的研究发现CSPP1是尾状核(CN)中唯一与AUD显著相关的基因;NAc meta分析基因未发现腹侧纹状体(VS)和壳核(PUT)与AUD相关。在CN、VS或PUT中,未发现PFC荟萃分析显著基因与AUD相关。

NAc和PFC荟萃分析的基因集富集分析(GSEA)揭示了四种KEGG(京都基因与基因组百科全书)途径。跨区域加权基因共表达网络分析(WGCNA)显示,没有模块与AUD相关。比较NAc_LIBD和PFC_LIBD模块,发现97.8%的基因在这两个模块中重叠,表明存在高水平的跨区域共表达。

AUD的治疗干预

精准医疗的潜力:数百种靶向新发现的deg的药物化合物的发现为药物再利用提供了令人兴奋的机会,为针对个体基因谱治疗AUD的精准医疗方法铺平了道路。

药物再利用数据库工具被用来识别潜在的DEG作为AUD的治疗靶点。特别有趣的是,研究人员发现了29种靶向NAc中deg的药物化合物和436种靶向PFC中deg的药物化合物,强调了药物再利用治疗AUD的潜力。在NAc中鉴定的54个DEG基因中,有11个基因被29种药物化合物靶向。此外,在PFC中与aud相关DGE的前100个基因中,有64个可以被436种药物化合物靶向。因此,本研究揭示了AUD的潜在药物治疗方法。

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