被免疫系统识别的癌细胞有哪些特征?了解免疫细胞的潜在靶结构是发展个体化癌症免疫疗法的基本前提。来自德国癌症研究中心(DKFZ)和海德堡NCT的科学家们正在发表一种基于质谱的高灵敏度方法，以识别这种肿瘤特异性的“新表位”。该分析方法设计用于检测这些低丰度的蛋白质片段，并且需要最少的样品材料。

个性化免疫疗法被认为是一种更有效地对抗癌症的有前途的方法。个性化免疫疗法包括治疗性癌症疫苗接种或T细胞细胞疗法，其受体是针对个体肿瘤量身定制的。所有个性化免疫疗法的发展都有一个基本的先决条件:必须知道癌症典型改变的蛋白质特征，患者的免疫系统通过这些特征识别癌细胞。

研究人员将被免疫系统识别的蛋白质突变片段称为“新表位”。为了检测它们，必须首先对肿瘤基因组进行测序。利用强大的生物信息学，DNA和RNA测序数据可以用来检测那些导致蛋白质改变的突变，因此理论上可以被患者的免疫系统识别为“外来”。

然而，为了激活免疫系统，改变后的蛋白质片段必须首先呈现在肿瘤细胞表面。DKFZ的免疫学家Angelika Riemer解释说:“只有那些由所谓的HLA蛋白在癌细胞膜上呈现的新表位才能激活T细胞。”

质谱(MS)被用来检测和鉴定这些新表位。这种分析方法是基于测定带电蛋白片段的质量。“质谱提供了新表位确实存在的唯一真实证据。然而，使用标准的质谱方法，低丰度肽(如肿瘤新表位)经常丢失而未被检测到，”研究人员解释说。

来自DKFZ和海德堡NCT的Angelika Riemer及其同事现在发表了一种分析方法，可以在未来更快、更准确地确定患者的个体癌症新表位。

利用肿瘤DNA和RNA的序列，研究人员首先缩小了有问题的蛋白质片段的范围。对HLA分子结合特性的精确了解也有助于预测哪些新表位最有可能出现在肿瘤表面。

现在有一个技巧:这些肽首先在实验室合成，并用于优化质谱仪对每个肽的分析设置。只有这样才能测量出真实的肿瘤组织样本:研究人员现在确切地知道了新表位最容易被检测到的设备设置。

Riemer解释说:“因此，新方案意味着更小的肿瘤组织样本就足以进行测量。”她的团队已经成功地在250万个癌细胞样本中发现了一个新表位。“这甚至还不到一粒沙子的体积，”免疫学家解释说。

该团队能够在来自三名患者的小肿瘤组织样本中检测到总共五个新表位，在某些情况下甚至可以通过患者T细胞的免疫反应来确认它们。

“个性化的癌症免疫疗法将在未来发挥越来越重要的作用，”资深作者Riemer说。“在这种情况下，MS提供了新表位出现在癌细胞表面的最终证据，因此是一个有价值的治疗靶点。我们的optiPRM方案将有助于从最小的组织样本中提供这一证据，并为临床医生提供有效的肿瘤表位，以进行个体化癌症治疗。”

目前正在进行临床试验的基于mrna的肿瘤疫苗通常包含大约30种不同的可预测的癌症新表位。Angelika Riemer很有信心:“我们相信，使用经过验证的新表位的靶向方法可以用更少的表位达到同样的效果。”专家们强调，更重要的是验证目标表位，以开发具有特定受体的治疗性T细胞，以特异性攻击癌细胞。