在实验室中，衣原体可以感染胃肠道上皮细胞，这支持了这种细菌可以在人体肠道中形成一个储存库的理论。

近期的研究表明，肠道组织可能是沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis）感染的一个自然生态位，并且可能成为人体持续感染的储库。由于这种病原体具有人类特异性，并且缺乏合适的宿主模型，我们对这一领域的了解还很有限。在本研究中，我们利用源自患者衍生的类器官的人原发性胃肠道（GI）上皮细胞，模拟了沙眼衣原体感染的过程。我们发现GI细胞对顶部感染具有抵抗力，C. trachomatis需要接触到基底外侧膜才能建立感染。通过传输电子显微镜分析，我们观察到感染细胞中存在正常以及异常的沙眼衣原体发育形态，这表明感染可能有细胞类型特异性。此外，我们展示了质粒编码的Pgp3是人GI细胞感染的重要毒力因子。这是首次报告C. trachomatis在人原发性肠道上皮细胞中的感染，支持了沙眼衣原体感染在人肠道组织中可能的生态位。

沙眼衣原体感染在全球范围内具有高流行率，是一个主要的公共卫生问题。未经治疗的感染可能导致并发症，进而引发严重的健康问题，尤其是在女性中。虽然感染通常局限于生殖道，但在小鼠感染模型中进行的实验以及累积的临床数据表明，人的胃肠道（GI）道可能代表了一个隐蔽的感染生态位和再感染的源头。在本研究中，我们利用类器官技术的优势，在患者衍生的原发性GI上皮细胞中模拟了沙眼衣原体感染。我们能够展示这些细胞对感染具有抵抗力，然而，沙眼衣原体能够利用基底外侧进入途径进行有效的感染。在这些GI上皮细胞中，沙眼衣原体形成了正常或持久类似发育形态。我们还展示了质粒介导的毒力在人GI细胞感染中的重要性。在GI感染模型中获得的结果复制了预测和期望的沙眼衣原体人类肠道感染的表型，因此支持人的GI道作为沙眼衣原体感染的潜在生态位。

Infection of human organoids supports an intestinal niche for Chlamydia trachomatis