在PacBio，我们致力于通过推动研究和发现的可能边界来彻底改变基因组学的未来。为了表彰在基因和细胞治疗方面的开创性研究，我们启动了PacBio STAR基金，为创新的科学家提供免费的HiFi测序机会和旅行津贴，以便在PacBio活动上展示他们的工作。

参与者的反应令人难以置信——形形色色的研究人员提交了提案，展示了他们将如何利用HiFi测序来促进基因和细胞治疗的发展和理解。几乎每一项提案都提出了创新的方法，以加强从罕见疾病到癌症等疾病的基因和细胞疗法。

我们激动地宣布2024年基因和细胞治疗研究STAR基金的获奖者。我们很高兴看到高保真测序将使这些研究人员在他们的工作中取得新的里程碑。 

获奖者:Ramiro Perrotta，哈佛医学院博士后

提案标题:碱基编辑酶的机器学习和定向进化

摘要:噬菌体辅助非连续进化(PANCE)已经成功地用于进化基因组编辑工具，如碱基编辑器。最近，我们展示了PANCE与NGS测序如何被证明是一种强大的工具，可以识别出能减少旁观者编辑（bystander edits）而不失去其活性的突变。与传统的基于停止密码子的方法相比，我们的研究采用了更低的进化压力。这种策略减缓了优质变异的富集，需要除了空斑测序之外的其他评估方法。虽然Illumina NGS对小蛋白质有效，但其600 bp的限制需要使用PacBio测序等技术来开发工作流程。

获奖者:Dawn Chen博德学院研究生

提案标题:单分子变异，用于识别导致癌症耐药的协同突变

摘要:我们开发了一种名为解旋酶辅助连续编辑(Helicase Assisted Continuous Editing，HACE)的工具，该工具允许对原生哺乳动物基因组进行远程靶向诱变。我们已经使用该工具对MEK1抑制剂耐药突变——这通常发生在癌症患者中——进行了功能表征。我们已经生成了具有多个突变的样本，并希望表征能通过协同相互作用诱导耐药性的共发生突变。目前，我们正在使用纳米孔进行单分子变异读取，这是非常容易出错的，并导致高假阳性率。像PacBio这样的高精度基础调用将是这个用例的理想选择。

获奖者:Yannick Brüggemann博士后，波鸿鲁尔大学 （Ruhr University Bochum）            

提案题目:开发基于CRISPR-Cas13的戊型肝炎病毒(HEV-CUT)治疗方法

摘要:戊型肝炎病毒(HEV)是全世界最常见的急性肝炎病因。我们的项目旨在开发一种基于CRISPR-Cas13的创新型HEV治疗方法。为了获得可靠的病毒基因组序列用于gRNA设计，我们收集了100例急性和50例慢性HEV患者样本进行测序。PacBio将使我们能够解决gRNA设计样本中的病毒多样性，也使我们能够跟踪HEV群体的进化，并识别和量化可能与免疫逃避或耐药性相关的次要变异。

入围者:Sandhiya Ravi博士后，UMass Chan Medical School

提案标题：利用PacBio SMRT测序技术，通过深度学习预测和预防重组腺相关病毒 truncation

摘要:用于基因治疗的重组AAV (rAAV)载体的截断降低了治疗效力，影响了剂量和成本。通过利用生成式人工智能，我们为向量截断创建了一个预测性深度学习模型，准确率为98%。为了验证该方法，我们合成了8个人工智能生成的序列，预测产生截断基因组的可能性最高。来自HiFi测序和后续AAV基因组群体测序分析的高分辨率数据将有助于验证我们的模型。这项研究将改进rAAV设计，减少载体杂质，提高基因治疗效果，与PacBio推进研究的使命保持一致。

入选者:Edina Poletto，斯坦福大学博士后

提案标题：自体基因组编辑造血干细胞治疗1型粘多糖病的临床进展

摘要: 我们开发了一个治疗罕见病的新平台。我们使用CRISPR-Cas9和AAV载体将基因传递到造血干细胞进行自体移植。通过这种方法，我们可以提供针对大多数组织的一次性治疗，同时避免同种异体移植的警告。我们正在进行IND的研究，对我们的疗法的靶向和脱靶效果进行彻底的分析是低效的。长读测序将使我们能够识别大的缺失、AAV插入和编辑效率，其分辨率是其他方法无法做到的。如果被证明是安全的，我们希望将我们的平台应用于治疗多种罕见疾病。

如何申请PacBio资助

PacBio资助计划邀请世界各地的研究人员申请免费的PacBio测序服务，用于各种基因组学研究项目。

要参与，请选择一个与您的研究领域相一致的积极的资助计划，并通过解释您的重要工作将如何从PacBio测序中受益来完成申请。每个应用程序都由专家彻底审查。PacBio将通知入选的优胜者安排免费测序，包括免费耗材、文库准备和初步生物信息学分析，所有这些都由授权的测序服务提供商提供(条款和条件适用)。对于2024 STAR基金对基因和细胞治疗研究的支持，我们感谢我们的服务提供商和共同发起人SeqCenter。

这些资助涵盖所有生命科学学科。无论您是在探索复杂的微生物组，复杂的癌症肿瘤，稀有和濒危物种，还是人类基因组的未知区域，都有适合您研究需求的资助!