在生命演化的长河中，洞穴环境造就了无数令人惊叹的适应性特征。中国科学家通过对穴居蜘蛛Leptonetela属的深入研究，揭开了极端黑暗环境下生物钟调控的奥秘。这项发表于《Science Advances》的研究，以三种光学表型差异显著的蜘蛛为模型：具完整视力的洞口种L. mengzongensis，以及两种无眼洞穴种L. sublunata和L. tetracantha。

野外行为学观测显示，在自然洞穴的永恒黑暗中，两种无眼洞穴蜘蛛表现出持续活跃的"洞穴表型"，其抱团反应（huddle response）行为丧失昼夜节律性。令人惊讶的是，当将这些洞穴种暴露于实验室单色蓝光（45.0 μW cm^-2）下，不仅行为节律得以重建，核心生物钟基因per、tim和cry也恢复振荡表达。这种"可唤醒的沉默表型"暗示着洞穴蜘蛛的生物钟机制并未真正丧失，而是处于待激活状态。

分子机制解析揭示了光输入通路的关键作用。qRT-PCR检测显示，洞穴种在自然状态下per表达持续低迷，最高值甚至低于地表种的最低水平。进一步研究发现，光敏基因cry的表达紊乱导致TIM蛋白降解异常，而RNAi敲低cry可使地表种重现洞穴表型。更引人注目的是，转录组分析鉴定出LARK-DBT调控轴的特殊作用——洞穴环境中lark表达上调2.1倍（log₂FC=1.1），通过抑制dbt表达阻碍PER蛋白的磷酸化降解。

进化分析带来了更深层的启示。尽管长期处于黑暗，四种核心生物钟基因（per、cry、lark、dbt）在洞穴种中仍受到强烈纯化选择（ω=0.0099-0.2012，P<1.79×10^-45）。时间序列转录组揭示，地表种在转入黑暗后，仍维持着脂代谢（map00565）和神经活动（map04728）相关基因的节律性表达，说明生物钟调控网络具有惊人的稳定性。

这项研究颠覆了传统认知：首先证明无眼生物可通过非视觉光感受（extraocular photoreception）重置生物钟；其次揭示LARK-DBT通路是黑暗适应的关键分子开关；最后提出"可切换生物钟"理论，为理解昼夜节律的进化提供了新视角。这些发现不仅解释了洞穴动物适应黑暗的分子机制，更为人类昼夜节律紊乱疾病治疗提供了新思路——特别是450 nm蓝光在调节睡眠-觉醒周期中的潜在应用价值。