三种降解椰油酰胺丙基甜菜碱(CPB)或甜菜碱细菌的基因组草图：Cupriavidus sp. CuC1、Variovorax sp. VaC1和Pseudomonas sp. PsB

首页今日动态人才市场新技术专栏中国科学人云展台
BioHot
云讲堂直播会展中心特价专栏技术快讯免费试用

生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏

生物通首页 > 今日动态 > 正文

《Microbiology Resource Announcements 0.7》：Draft genomes of three bacteria capable of growing on cocamidopropyl betaine or N,N,N-trimethylglycine (betaine): Cupriavidus sp. CuC1, Variovorax sp. VaC1, and Pseudomonas sp. PsB

【字体：大中小】 时间：2025年03月21日 来源：Microbiology Resource Announcements 0.7

编辑推荐：

　　本研究报道了能降解表面活性剂CPB或渗透调节剂甜菜碱的三种环境细菌基因组特征。来自美国的研究人员通过土壤富集培养分离出Pseudomonas sp. PsB（专性降解甜菜碱）、Cupriavidus sp. CuC1和Variovorax sp. VaC1（专性降解CPB），完成Illumina NovaSeq X平台测序和SPAdes组装，获得覆盖度381-650×的基因组草图。该研究为解析表面活性剂生物降解机制及环境修复提供重要菌种资源。

Agilent BioTek Synergy LX经济型多功能微孔板检测仪具有吸收光、荧光和发光检测模式，详细资料领取

为了促进科学的传播，生物通采集了这篇文章，订阅Biohot解锁原文索取

　　科研人员成功解析了三株具有特殊代谢能力的细菌基因组

【技术干货适合收藏】Step by step解析如何巧妙获得更清晰的小鼠视网膜血管成像领取

广告液相色谱以旧换新——不论新旧，不论好坏，不论品牌

特征。Pseudomonas sp. PsB能以N,N,N-三甲基甘氨酸（甜菜碱）为唯一碳源生长，而Cupriavidus sp. CuC1和Variovorax sp. VaC1则专性降解化妆品和消防泡沫中的表面活性剂椰油酰胺丙基甜菜碱(CPB)。这些菌株分离自美国某空军基地附近91-203 cm深度的污染土壤，通过氨矿物盐(AMS)培养基富培养获得。研究采用Illumina NovaSeq X平台进行双端150 bp测序，经Trimmomatic质控后使用SPAdes v4.0.0完成基因组组装，最终获得contig N₅₀达57-987 kb、基因组覆盖度381-650×的高质量草图。值得注意的是，16S rRNA基因比对显示PsB与Pseudomonas plecoglossicida NBRC 103162相似度达99.93%。该成果为揭示CPB生物降解途径及开发环境修复技术奠定了重要基础。

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析！

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》