探秘前列腺癌体细胞遗传驱动因素:全基因组分析开启新征程

《GeroScience》:Uncovering somatic genetic drivers in prostate cancer through comprehensive genome-wide analysis

【字体: 时间:2025年03月30日 来源:GeroScience 5.3

编辑推荐:

  为探索散发性前列腺癌(PCa)的体细胞遗传驱动因素,研究人员开展了全基因组分析研究。他们整合多个数据集,鉴定出 150 个与 PCa 有因果关联的基因,其中 MSMB 基因尤为关键。该研究为 PCa 发病机制提供新视角,助力药物研发。

  鉴于遗传性前列腺癌(PCa)仅占 PCa 表型的一小部分,探索导致散发性 PCa 的体细胞遗传驱动因素仍任重道远。研究人员从基因型组织表达(GTEx)数据集获取前列腺特异性基因的表达数量性状位点(eQTLs)数据,收集了 5854 个基因的汇总统计信息。从三个成熟的联盟(英国生物银行 9131 例病例和 173493 例对照、前列腺癌风险基因关联研究(PRACTICAL)79148 例病例和 61106 例对照、芬兰基因队列 13216 例病例和 119948 例对照)提取与 PCa 的遗传关联。为确定潜在因果靶点的优先级,研究人员进行了额外分析,包括蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)、癌症基因组图谱(TCGA)数据集和单细胞类型表达分析。总体而言,共鉴定出 150 个与 PCa 具有相同因果关联的常见显著基因。在检测的 150 个基因中,67.33%(101/150)具有蛋白质编码功能,而这些基因中只有 30.67%(46/150)在科学文献中曾被提及。值得注意的是,TCGA 数据集的分析显示,只有 44.67%(67/150)的基因与孟德尔随机化(MR)分析结果一致。此外,单细胞 RNA 测序数据评估和共定位分析筛选出 MSMB 作为与 PCa 发生相关的关键基因。研究人员确定了一系列与 PCa 发病具有因果关联的前列腺特异性基因。其中,MSMB 基因成为与 PCa 相关的关键因素,在 MR、TCGA 数据集、单细胞 RNA 测序数据和共定位分析这四项评估中均表现出高度一致性。这些发现为 PCa 的发病机制提供了新视角,并为药物开发提供了潜在靶点。

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普

今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号