野生动物研究中一个极具吸引力的挑战是理解栖息地异质性与生物多样性之间的关系。陆地表面由生态多样的区域组成。因此，广泛分布的生物物种会进化出众多生态形式和遗传适应种群，在特定条件下这些种群可能演变成新物种。例如，生活在河流中的淡水鱼，在特定环境因素的压力下，会形成独特的生物学特征和基因库。理解物种结构的一种方法是，基于关键生态和生物学标准对其分布范围的异质性进行 “区域划分”，并评估物种分布范围内不同区域种群的遗传差异。这包括根据环境特征和扩散（基因流）的地理屏障，将区域划分为生态地理区域。以远东流域为例，研究重点关注特定物种遗传相似种群（或单个遗传独特种群）繁殖生态地理单元之间和内部的遗传变异，进而探讨物种的种内遗传结构。这意味着物种分布范围存在一种分层结构，由生态地理区域、单元和地方种群构成。研究以商业价值重要的大麻哈鱼（Oncorhynchus keta）和濒危的萨哈林哲罗鱼（Hucho perryi）为例，展示了如何从遗传学角度识别和验证生态地理单元，并讨论了旨在保护生物多样性的物种管理策略的相关方面。

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